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高通量測(cè)序技術(shù)在感染病原檢測(cè)中的應(yīng)用與展望

發(fā)布時(shí)間:2020-12-05 12:36
  近年來(lái),隨著高通量測(cè)序技術(shù),也稱新一代(或下一代)測(cè)序技術(shù)(NGS)的迅猛發(fā)展,在操作流程不斷簡(jiǎn)化、檢測(cè)通量不斷增長(zhǎng)的同時(shí),檢測(cè)成本也大大降低,使其在感染病原檢測(cè)中呈現(xiàn)出一定的技術(shù)優(yōu)勢(shì),并得到越來(lái)越廣泛的引用。采用NGS技術(shù)對(duì)臨床標(biāo)本直接進(jìn)行病原檢測(cè)的策略包括目標(biāo)擴(kuò)增子測(cè)序和基于宏基因組測(cè)序(mNGS),尤以后者應(yīng)用更廣。mNGS通過(guò)直接檢測(cè)臨床標(biāo)本中病原核酸,幫助明確標(biāo)本中微生物的種類和相對(duì)數(shù)量,無(wú)需對(duì)病原菌進(jìn)行培養(yǎng)即能夠幫助確定引起感染的病原。目前的檢測(cè)服務(wù)多由專業(yè)的測(cè)序公司提供。對(duì)檢測(cè)結(jié)果及其應(yīng)用價(jià)值的考察和評(píng)價(jià)應(yīng)從以下幾項(xiàng)技術(shù)指標(biāo)進(jìn)行:測(cè)序深度、序列數(shù)量、覆蓋度、置信度、相對(duì)豐度。此外,使用NGS數(shù)據(jù)對(duì)病原生物學(xué)特性(如藥物敏感性)也可進(jìn)行準(zhǔn)確分析,在結(jié)核桿菌等病原的檢測(cè)中已得到良好的應(yīng)用。未來(lái),NGS在檢測(cè)技術(shù)、檢測(cè)流程、檢測(cè)性能、檢測(cè)結(jié)果應(yīng)用等方面的快速發(fā)展必將對(duì)臨床感染病原檢測(cè)帶來(lái)巨大的技術(shù)和應(yīng)用革新,同時(shí)也必將給相關(guān)從業(yè)者帶來(lái)巨大挑戰(zhàn)和發(fā)展機(jī)遇。 

【文章來(lái)源】:中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2020年05期 第533-539頁(yè) 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)


本文編號(hào):2899463

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