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亞麻高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建和纖維相關(guān)性狀QTLs分析

發(fā)布時間:2020-06-27 11:18
【摘要】:亞麻(LinumusitatissimumL.)是我國重要的經(jīng)濟(jì)作物,播種面積居世界首位。亞麻育種的主要目標(biāo)是培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)和抗病性強(qiáng)的新品種,利用分子標(biāo)記輔助選擇育種可以更準(zhǔn)確的選擇目標(biāo)性狀,縮短選擇周期,提高育種效率。分子標(biāo)記技術(shù)在亞麻種質(zhì)資源分類、系統(tǒng)演化、遺傳圖譜構(gòu)建、抗病基因鑒定及分離克隆研究方面已經(jīng)有較多應(yīng)用。但可用于亞麻育種的特異性分子標(biāo)記還較少,不能滿足人們的需要。開發(fā)亞麻分子標(biāo)記、構(gòu)建高密度亞麻遺傳連鎖圖譜、完善亞麻基因組序列組裝、定位亞麻纖維相關(guān)性狀可為亞麻目標(biāo)性狀的精細(xì)定位、優(yōu)良基因克隆及分子標(biāo)記育種奠定研究基礎(chǔ)。本論文以亞麻分子標(biāo)記輔助選擇育種為目標(biāo)開展研究,取得如下進(jìn)展:1.用簡化基因組測序技術(shù)開發(fā)出亞麻特異性SSR序列1576條,利用其中62個SSR標(biāo)記可將48個亞麻供試材料分為油用型和纖維型亞麻2大類。2.優(yōu)化了亞麻SSR、SRAP分子標(biāo)記技術(shù)體系。利用優(yōu)化體系分別從100對SSR引物和88對SRAP引物中篩選出24對SSR多態(tài)性引物和32對SRAP多態(tài)性引物,用于亞麻遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建。3.以纖用亞麻栽培種“DIANE”和油用亞麻栽培種“寧亞17”為親本配制雜交組合,構(gòu)建F2代分離群體。利用SSR標(biāo)記和SRAP標(biāo)記構(gòu)建了亞麻初級遺傳連鎖圖譜,該圖譜含有12個連鎖群,圖距總長度為546.5cM,總標(biāo)記95個,其中24個為SSR標(biāo)記,71個為SRAP標(biāo)記。在構(gòu)建初級遺傳連鎖圖譜基礎(chǔ)上,利用高通量測序技術(shù)檢測SLAF多態(tài)性標(biāo)記,構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜。該圖譜包含15個連鎖群,圖距總長度為1483.25 cM,總標(biāo)記2339個,是目前密度最高的亞麻遺傳連鎖圖譜。4.基于亞麻基因組信息,結(jié)合高密度遺傳連鎖圖譜,構(gòu)建全基因組scaffold輔助染色體組裝圖譜,1321條scaffold掛載于亞麻15條染色體,組裝信息占亞麻全基因組的11.6%,準(zhǔn)確地排序和確定方向的scaffold占組裝信息的26.27%。5.基于亞麻高密度分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜,檢測出10個控制亞麻株高、工藝長度、種子產(chǎn)量、原莖產(chǎn)量、纖維產(chǎn)量及纖維含量的QTLs。利用分子標(biāo)記將上述10個QTLs定位于基因組scaffold物理片段。
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S563.2
【圖文】:

亞麻,蒴果


用型、油用型和油纖兼用型亞麻。亞麻屬有100多個種,既有一年生亞麻,也有多年生逡逑亞麻。多年生亞麻多為野生種,主要分布在熱帶和溫帶地區(qū)。亞麻屬中有15個栽培種,逡逑栽培亞麻屬于一年生作物。亞麻全植株由根、莖、葉、花、蒴果5部分組成(圖1-1)。逡逑m邐f邐^逡逑*.邐§逡逑:逡逑'v邋擎r邋—邋1逡逑%逡逑*邋i.逡逑圖1-1亞麻(1.根2.莖3.葉4.花5.蒴果)逡逑Figure邋1-1邋Flax邋morphology邋(I.Root邋2.邋Stem邋3.邋Leaf邋4.邋Flower邋5.邋Capsule)逡逑中國有5000多年的亞麻栽培歷史[1]。全國每年亞麻的播種面積約100萬hm2,分布于逡逑全國15個省和自治區(qū)(圖1-2),居世界第一位。其中,纖用亞麻約17萬hm2,主要分布逡逑在中國東北地區(qū),黑龍江省種植總面積和總產(chǎn)均占全國的80%以上,其次是新疆和云南逡逑等地,小部分分布于湖南、內(nèi)蒙古等地;油用亞麻的全國播種面積近83萬hm2,主要集逡逑中分布在甘肅、內(nèi)蒙古、新疆及青海等省和自治區(qū)。隨著生活水平提高,人們對亞麻纖逡逑維制品的質(zhì)量和數(shù)量需求不斷提高。目前,纖用亞麻種植面積有繼續(xù)擴(kuò)大的趨勢,麻農(nóng)逡逑種植亞麻的經(jīng)濟(jì)效益逐漸顯現(xiàn),部分糧食作物主產(chǎn)區(qū)逐漸出現(xiàn)經(jīng)濟(jì)作物多元化種植的趨逡逑勢

亞麻,主要種,灰色區(qū)域,省份


用型、油用型和油纖兼用型亞麻。亞麻屬有100多個種,既有一年生亞麻,也有多年生逡逑亞麻。多年生亞麻多為野生種,主要分布在熱帶和溫帶地區(qū)。亞麻屬中有15個栽培種,逡逑栽培亞麻屬于一年生作物。亞麻全植株由根、莖、葉、花、蒴果5部分組成(圖1-1)。逡逑m邐f邐^逡逑*.邐§逡逑:逡逑'v邋擎r邋—邋1逡逑%逡逑*邋i.逡逑圖1-1亞麻(1.根2.莖3.葉4.花5.蒴果)逡逑Figure邋1-1邋Flax邋morphology邋(I.Root邋2.邋Stem邋3.邋Leaf邋4.邋Flower邋5.邋Capsule)逡逑中國有5000多年的亞麻栽培歷史[1]。全國每年亞麻的播種面積約100萬hm2,分布于逡逑全國15個省和自治區(qū)(圖1-2),居世界第一位。其中,纖用亞麻約17萬hm2,主要分布逡逑在中國東北地區(qū),黑龍江省種植總面積和總產(chǎn)均占全國的80%以上,其次是新疆和云南逡逑等地,小部分分布于湖南、內(nèi)蒙古等地;油用亞麻的全國播種面積近83萬hm2,主要集逡逑中分布在甘肅、內(nèi)蒙古、新疆及青海等省和自治區(qū)。隨著生活水平提高,人們對亞麻纖逡逑維制品的質(zhì)量和數(shù)量需求不斷提高。目前,纖用亞麻種植面積有繼續(xù)擴(kuò)大的趨勢,麻農(nóng)逡逑種植亞麻的經(jīng)濟(jì)效益逐漸顯現(xiàn),部分糧食作物主產(chǎn)區(qū)逐漸出現(xiàn)經(jīng)濟(jì)作物多元化種植的趨逡逑勢

【參考文獻(xiàn)】

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1 李明;姜碩;鄭東澤;楊勇;;亞麻SRAP標(biāo)記連鎖圖譜的構(gòu)建及3個數(shù)量性狀的定位[J];東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報;2014年02期

2 吳建忠;黃文功;康慶華;趙東升;袁紅梅;于瑩;劉巖;姜衛(wèi)東;程莉莉;宋喜霞;趙茜;吳廣文;關(guān)鳳芝;;亞麻遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[J];作物學(xué)報;2013年06期

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6 吳建忠;黃文功;趙東升;康慶華;劉巖;趙茜;;亞麻SRAP反應(yīng)體系的優(yōu)化和多態(tài)性標(biāo)記篩選[J];中國麻業(yè)科學(xué);2011年06期

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10 康慶華;黃文功;劉巖;姜衛(wèi)東;趙東升;宋喜霞;孫中義;吳廣文;關(guān)鳳芝;;應(yīng)用分子標(biāo)記探討多胚亞麻的分類地位[J];中國麻業(yè)科學(xué);2010年02期



本文編號:2731756

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