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用農(nóng)藝性狀和分子標(biāo)記評(píng)估引入小麥資源的遺傳多樣性

發(fā)布時(shí)間:2020-10-31 15:59
   小麥?zhǔn)侵匾募Z食作物,種類繁多。對(duì)小麥進(jìn)行遺傳多樣性的分析,有利于種質(zhì)資源保存和育種親本選配,同時(shí),可以為小麥種質(zhì)親緣關(guān)系的研究提供理論依據(jù)。本試驗(yàn)以445個(gè)不同來(lái)源的小麥品種為供試材料,通過(guò)調(diào)查農(nóng)藝性狀和分子標(biāo)記分別進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)論如下:(1)各農(nóng)藝性狀表現(xiàn):抽穗期、開花期、株高、穗長(zhǎng)、小穗數(shù)及千粒重的變異系數(shù)范圍在2.77%—22.47%之間。千粒重變異系數(shù)最大,開花期最小。對(duì)芒長(zhǎng)、蠟質(zhì)、抗倒伏性及穗形分類進(jìn)行統(tǒng)計(jì),表明該群體多表現(xiàn)為易倒伏、長(zhǎng)芒、輕蠟及橢圓狀穗形。(2)基于農(nóng)藝性狀通過(guò)主成分分析及聚類分析將445份小麥種質(zhì)進(jìn)行分類,兩者得到的結(jié)果相似。主成分分析將材料分為了兩大類,一類來(lái)源于美國(guó),另一類大多來(lái)源于ICARDA,混有部分美國(guó)材料。聚類分析將材料分為了兩大類,其中第一類群多來(lái)源于美國(guó),同時(shí),第二亞群又可分為兩類,分別包含大多數(shù)美國(guó)來(lái)源種質(zhì)資源與ICARDA來(lái)源種質(zhì)資源。(3)基于分子標(biāo)記通過(guò)群體分析及聚類分析對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行分類得知:群體分析將所有種質(zhì)分為兩大類,第一亞群包含了大多數(shù)來(lái)源于美國(guó)的品種及極少數(shù)來(lái)源于ICARDA的品種;第二亞群包含了絕大多數(shù)來(lái)源于ICARDA的品種及部分美國(guó)品種。聚類分析將材料分為三大類,第一類為美國(guó)來(lái)源,第二類為ICARDA來(lái)源,第三類則可進(jìn)一步分為五個(gè)亞群,各亞群的材料多來(lái)源較單一,大多為相同材料來(lái)源。(4)本試驗(yàn)中,通過(guò)農(nóng)藝性狀及分子標(biāo)記進(jìn)行的遺傳多樣性分析結(jié)果上較為一致,均可以將種質(zhì)資源按照來(lái)源的不同進(jìn)行分類,同時(shí)表明來(lái)源于ICARDA的種質(zhì)資源的遺傳差異較小,聚集效果明顯,來(lái)源于美國(guó)的種質(zhì)資源的遺傳差異較之更大。(5)對(duì)兩種不同方式的聚類距離結(jié)果分別構(gòu)造距離矩陣并進(jìn)行Mantel檢驗(yàn),兩者顯著相關(guān),但相關(guān)系數(shù)僅為0.05681。將10個(gè)性狀指標(biāo)進(jìn)行排列組合分別進(jìn)行聚類分析并與分子標(biāo)記結(jié)果進(jìn)行Mantel檢驗(yàn),得到抽穗期、株高、穗長(zhǎng)、小穗數(shù)、千粒重、抗倒伏性等六個(gè)指標(biāo)組合得到的聚類結(jié)果與分子標(biāo)記結(jié)果最為相近,為0.4256,然而,由抽穗期、開花期、株高、穗長(zhǎng)、小穗數(shù)、穗粒數(shù)、千粒重、芒長(zhǎng)、蠟質(zhì)及抗倒伏性等九個(gè)指標(biāo)得到的結(jié)果卻與分子標(biāo)記呈負(fù)相關(guān),說(shuō)明在該群體中,兩種方式的聚類一致性較低。(6)通過(guò)親緣關(guān)系較近的種質(zhì)資源作為內(nèi)標(biāo)比較通過(guò)表型與分子兩種方式的聚類是否一致,結(jié)果表明,兩者的一致性較低。
【學(xué)位單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S512.1
【部分圖文】:

種質(zhì)資源,第一主成分,特征值,碎石


圖 3-2 Cattell 碎石檢驗(yàn)Figure 3-2 Scree plot Cattell analysis2所述,對(duì)于全部種質(zhì)資源來(lái)說(shuō),第一主成分的特征值為2.57,應(yīng)的特征向量以抽穗期、開花期、千粒重和芒長(zhǎng)四個(gè)性狀分量的特征值為1.83,其貢獻(xiàn)率為18.92%,對(duì)應(yīng)的特征向量以穗長(zhǎng)、

主成分分析,材料


征向量以株高、千粒重和芒長(zhǎng)三個(gè)性狀分量的影響最大。對(duì)全部的445份小麥種植資源,選取前兩個(gè)主成分做主成分分析圖,按照材料來(lái)源分類,將其分為美國(guó)、ICARDA兩類。由圖3-3可知,來(lái)源于美國(guó)的材料整體分布較散,說(shuō)明來(lái)源于美國(guó)的材料內(nèi)部的遺傳距離較遠(yuǎn);來(lái)源于ICARDA的材料整體分布比較集中,只有極少的材料較遠(yuǎn)。對(duì)來(lái)源于美國(guó)與ICARDA的兩個(gè)群體來(lái)說(shuō),兩者基本上可以區(qū)分開來(lái),但來(lái)源于美國(guó)的部分材料會(huì)與ICARDA的相互混合。來(lái)源于ICARDA的材料受到PC1的影響更大,即整體上表現(xiàn)出抽穗期、開花期較晚、芒長(zhǎng)、千粒重較小的特征。PC2

種質(zhì)資源,農(nóng)藝性狀,藍(lán)色,材料


注:紅色表示來(lái)源于美國(guó)的種質(zhì)資源,藍(lán)色表示來(lái)源于 ICARDA 的種質(zhì)資源。3.1.3 利用農(nóng)藝性狀進(jìn)行聚類分析根據(jù)所有445份材料的10個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行聚類分析(圖3-4)。繪制聚類圖以顯示各種材料之間的多樣性和關(guān)系?偣445份材料按照遺傳距離的遠(yuǎn)近可以主要分為3個(gè)組(I、II和III),其中,I類遺傳距離最遠(yuǎn),II類次之,III類最近。第I類共有29個(gè)材料,包括來(lái)源于美國(guó)的材料26份以及來(lái)源于ICARDA的材料3份。II類主要包含218個(gè)材料,包括來(lái)源于美國(guó)的材料共46份,來(lái)源于ICARDA的材料共172份。III類主要包含198個(gè)材料,包括來(lái)源于美國(guó)的195份材料、來(lái)源于ICARDA的材料3份?梢钥隙ǖ氖,根據(jù)農(nóng)藝性狀,大多數(shù)來(lái)源不同的材料能夠按照不同來(lái)源聚為一組,在不同的亞群中可以看到大的多樣性。此群體中美國(guó)的材料遺傳多樣性大于ICARDA材料。在該群體中,兩兩材料之間的聚類距離最大為39.73。其中
【參考文獻(xiàn)】

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