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三角帆蚌3個貝殼基質(zhì)蛋白基因的克隆及功能分析

發(fā)布時間:2020-12-07 00:39
  三角帆蚌(Hypriosis cumingii)是我國特有的淡水育珠蚌,所產(chǎn)淡水珍珠產(chǎn)量約占總產(chǎn)量的80%以上。珍珠和貝殼是由碳酸鈣組成,經(jīng)生物礦化過程形成;|(zhì)蛋白在生物礦化產(chǎn)物的形成中起了十分重要的作用。對基質(zhì)蛋白的鑒定和研究可以幫助我們更好地了解貝殼和珍珠的形成機(jī)理。本文從三角帆蚌外套膜中克隆和鑒定了3個新的基質(zhì)蛋白基因,分別是silkmaxin和hic6,hic7,分析了這3個基因?qū)φ渲榈男纬山Y(jié)構(gòu)和功能上所起的作用。從三角帆蚌外套膜中克隆得到新的基質(zhì)蛋白基因silkmaxin,hic7和hic6,silkaxin基因的cDNA序列,全長1151bp,ORF為885bp,共編碼294個氨基酸包含前面15個信號肽,消除信號肽以后的理論分子量和等電點(diǎn)分別為28.39kDa,9.52,說明此蛋白為一堿性蛋白。Hic7基因的cDNA序列全長為459bp,ORF 240bp,加上前19個信號肽共編碼了79個氨基酸,消除信號肽的理論等電點(diǎn)為6.12,理論分子量為6.80kDa。Hic6基因的cDNA全長為449bp,其中ORF為219bp,共編碼了73個氨基酸包含前20個信號肽,消除信號肽后... 

【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
第一章 貝類生物礦化的研究進(jìn)展
    1.1 生物礦化概述
        1.1.1 生物礦化
        1.1.2 生物礦化的分類
        1.1.3 研究生物礦化的意義
    1.2 貝類的生物礦化
        1.2.1 貝殼結(jié)構(gòu)
        1.2.2 貝殼角質(zhì)層形成
        1.2.3 貝殼棱柱層形成
        1.2.4 貝殼珍珠層的形成和生長機(jī)制
        1.2.5 貝殼的有機(jī)組成
        1.2.6 貝殼基質(zhì)蛋白的研究
    1.3 分子生物學(xué)育種
        1.3.1 分子育種
        1.3.2 有關(guān)珍珠顏色基因的研究
    1.4 總結(jié)與展望
第二章 三角帆蚌類絲狀基質(zhì)蛋白silkmaxin基因的克隆及其在生物礦化中的作用
    2.1 材料和方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    2.2 結(jié)果分析
        2.2.1 cDNA克隆及序列分析
        2.2.2 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
        2.2.3 組織熒光定量分析
        2.2.4 silkmaxin 的原位雜交檢測
        2.2.5 silkmaxin 在珍珠囊形成過程中的表達(dá)
        2.2.6 RNA干擾實(shí)驗(yàn)及熒光定量分析
    2.3 討論
第三章 參與珍珠形成的三角帆蚌富含半胱氨酸的貝殼基質(zhì)蛋白hic7 基因
    3.1 材料和方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 結(jié)果
        3.2.1 cDNA克隆及序列分析
        3.2.2 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
        3.2.3 組織熒光定量分析
        3.2.4 原位雜交
        3.2.5 在珍珠囊形成過程中的表達(dá)
        3.2.6 RNA干擾
    3.3 討論
第四章 三角帆蚌貝殼基質(zhì)蛋白hic6基因的克隆和功能鑒定以及對珍珠層顏色性狀的關(guān)聯(lián)性分析
    4.1 材料和方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 結(jié)果分析
        4.2.1 基因克隆
        4.2.2 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
        4.2.3 組織熒光定量分析
        4.2.4 原位雜交
        4.2.5 在珍珠囊形成過程中基因hic6 的表達(dá)
        4.2.6 RNA干擾試驗(yàn)
        4.2.7 SNP位點(diǎn)篩選
        4.2.8 多態(tài)性分析
        4.2.9 三角帆蚌hic6 SNPs位點(diǎn)與內(nèi)殼色性狀關(guān)聯(lián)分析
        4.2.10 三角帆蚌hic6基因的SNP位點(diǎn)單倍型分析
    4.3 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝



本文編號:2902294

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