加味腦泰方對(duì)血管性癡呆模型大鼠海馬組織mRNA表達(dá)譜的微陣列分析
發(fā)布時(shí)間：2020-12-07 14:31
目的采用微陣列技術(shù)分析加味腦泰方干預(yù)前后血管性癡呆（VD）模型大鼠海馬組織m RNA表達(dá)譜,以探究其治療VD的分子機(jī)制。方法采用雙側(cè)頸總動(dòng)脈結(jié)扎術(shù)制作VD大鼠模型,給予加味腦泰方治療30 d,HE染色和水迷宮實(shí)驗(yàn)評(píng)價(jià)治療效果,Agilent mRNA表達(dá)譜芯片獲取加味腦泰方干預(yù)前后VD模型大鼠海馬組織m RNA表達(dá)數(shù)據(jù),微陣列分析篩選顯著差異表達(dá)的基因,構(gòu)建蛋白與蛋白相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò),GO和Pathway富集分析差異基因主要參與的生物學(xué)過程和信號(hào)通路,利用免疫組化和實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）驗(yàn)證芯片分析結(jié)果。結(jié)果 HE染色和水迷宮實(shí)驗(yàn)顯示VD大鼠呈現(xiàn)腦缺血、海馬神經(jīng)細(xì)胞損傷、空間學(xué)習(xí)記憶能力下降,加味腦泰方可以部分逆轉(zhuǎn)該現(xiàn)象。微陣列技術(shù)分析篩選出加味腦泰方干預(yù)前后差異表達(dá)的基因469個(gè),其中上調(diào)180個(gè),下調(diào)289個(gè),IL6、FGF2、TNF、IL1b等可能是其治療VD的主要藥效靶點(diǎn),免疫組化和qRT-PCR驗(yàn)證了該分析結(jié)果。GO和Pathway富集分析顯示,這些基因與炎癥反應(yīng)、凋亡過程等生物學(xué)過程密切相關(guān),主要參與了TNF信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡途徑...
【文章來源】：中草藥. 2019年24期 第6064-6072頁 北大核心
【文章頁數(shù)】：9 頁
【部分圖文】：
加味腦泰方對(duì)VD大鼠學(xué)習(xí)和記憶能力的影響
差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析
差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析結(jié)果見圖3。將469個(gè)差異表達(dá)的基因?qū)氲絊TRING數(shù)據(jù)庫(kù)獲取這些基因的PPI網(wǎng)絡(luò)（圖3-A），排除部分非編碼基因和lncRNA等未獲得蛋白相互作用信息外，共有174個(gè)基因編碼的蛋白之間存在351種相互作用關(guān)系。網(wǎng)絡(luò)中根據(jù)每個(gè)蛋白相互作用關(guān)系的多少來確定節(jié)點(diǎn)的大小和顏色深度，其中處于網(wǎng)絡(luò)中心擁有最多相互作用的蛋白為Il6(degree=32），其次為Fgf2(degree=17）和Tnf(degree=17）、Il1b(degree=15）。對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)中的基因進(jìn)行GO和通路富集分析描述這些基因在疾病發(fā)生發(fā)展中參與的生物學(xué)過程。GO富集結(jié)果表明加味腦泰方干預(yù)后主要影響了急性炎癥反應(yīng)、衰老、JUN激酶活性的正調(diào)控、凋亡過程、血管生成、缺氧反應(yīng)、細(xì)胞對(duì)神經(jīng)生長(zhǎng)因子刺激的反應(yīng)等生物學(xué)過程（圖3-C），通路富集分析顯示這些基因主要參與了TNF信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、c GMP-PKG信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡途徑、PI3K-Akt信號(hào)通路和MAPK信號(hào)通路（圖3-D）。同時(shí)利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)的kmeans＿clusters功能對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)淠K（Cluster）分析，獲得2個(gè)重要的拓?fù)淠K（圖3-B）。其中Cluster1處于PPI網(wǎng)絡(luò)中心，可能是加味腦泰方治療VD大鼠的重要藥效途徑，主要與凋亡途徑、調(diào)節(jié)炎癥和免疫信號(hào)通路（NOD-like receptor signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway）密切相關(guān)，而Cluster2主要與核糖體、核蛋白體轉(zhuǎn)運(yùn)及細(xì)胞對(duì)神經(jīng)生長(zhǎng)因子刺激的反應(yīng)有關(guān)。圖3 差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中藥復(fù)方防治血管性癡呆的實(shí)驗(yàn)研究進(jìn)展[J]. 楊夢(mèng)琳,張運(yùn)輝,伍大華. 中醫(yī)藥信息. 2019(04)
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[3]血管性癡呆中醫(yī)治療研究進(jìn)展[J]. 徐再寧,譚文瀾,劉凱模,梁彥啟. 實(shí)用中醫(yī)藥雜志. 2019(06)
[4]Bioinformatics analyses of differentially expressed genes associated with spinal cord injury:a microarray-based analysis in a mouse model[J]. Lei Guo,Jing Lv,Yun-Fei Huang,Ding-Jun Hao,Ji-Jun Liu. Neural Regeneration Research. 2019(07)
[5]細(xì)葉遠(yuǎn)志皂苷調(diào)控膽堿能神經(jīng)環(huán)路改善血管性癡呆小鼠認(rèn)知功能障礙的研究[J]. 吳桓宇,蔣輝,姜亞軍. 臨床和實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2018(16)
[6]中醫(yī)藥治療血管性癡呆研究概況[J]. 李強(qiáng),耿秀超,聶金濤,于文濤. 中醫(yī)臨床研究. 2018(12)
[7]從中醫(yī)五臟論血管性癡呆的病機(jī)[J]. 郭清,宮洪濤. 中國(guó)中醫(yī)藥現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育. 2018(01)
[8]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激PERK通路在腦泰方提取物保護(hù)局灶性腦缺血大鼠海馬神經(jīng)元中的作用[J]. 石詠梅,馬英民,廖君,易亞喬,余清平,黃娟,葛金文. 中國(guó)老年學(xué)雜志. 2017(22)
[9]中藥腦泰方對(duì)大鼠腦缺血后VEGF和Angiopoietins表達(dá)的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 宋禎彥,周瑜,王珊珊,龔勝?gòu)?qiáng),劉曉丹,李平,王國(guó)佐. 湖南中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[10]三七制劑對(duì)血管性癡呆大鼠海馬區(qū)COX-2表達(dá)的影響[J]. 楊同,劉志輝,王欣,徐萍萍,孫文卿. 濰坊醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(03)
博士論文
[1]血管性癡呆中醫(yī)理論探討及益氣活血祛痰法防治作用研究[D]. 易亞喬.湖南中醫(yī)藥大學(xué) 2017
碩士論文
[1]腦泰方湯劑和膠囊劑中化學(xué)成分的定量研究[D]. 陳鎮(zhèn).湖南中醫(yī)藥大學(xué) 2005
本文編號(hào)：2903424
【文章來源】：中草藥. 2019年24期 第6064-6072頁 北大核心
【文章頁數(shù)】：9 頁
【部分圖文】：
加味腦泰方對(duì)VD大鼠學(xué)習(xí)和記憶能力的影響
差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析
差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析結(jié)果見圖3。將469個(gè)差異表達(dá)的基因?qū)氲絊TRING數(shù)據(jù)庫(kù)獲取這些基因的PPI網(wǎng)絡(luò)（圖3-A），排除部分非編碼基因和lncRNA等未獲得蛋白相互作用信息外，共有174個(gè)基因編碼的蛋白之間存在351種相互作用關(guān)系。網(wǎng)絡(luò)中根據(jù)每個(gè)蛋白相互作用關(guān)系的多少來確定節(jié)點(diǎn)的大小和顏色深度，其中處于網(wǎng)絡(luò)中心擁有最多相互作用的蛋白為Il6(degree=32），其次為Fgf2(degree=17）和Tnf(degree=17）、Il1b(degree=15）。對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)中的基因進(jìn)行GO和通路富集分析描述這些基因在疾病發(fā)生發(fā)展中參與的生物學(xué)過程。GO富集結(jié)果表明加味腦泰方干預(yù)后主要影響了急性炎癥反應(yīng)、衰老、JUN激酶活性的正調(diào)控、凋亡過程、血管生成、缺氧反應(yīng)、細(xì)胞對(duì)神經(jīng)生長(zhǎng)因子刺激的反應(yīng)等生物學(xué)過程（圖3-C），通路富集分析顯示這些基因主要參與了TNF信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路、c GMP-PKG信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡途徑、PI3K-Akt信號(hào)通路和MAPK信號(hào)通路（圖3-D）。同時(shí)利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)的kmeans＿clusters功能對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)淠K（Cluster）分析，獲得2個(gè)重要的拓?fù)淠K（圖3-B）。其中Cluster1處于PPI網(wǎng)絡(luò)中心，可能是加味腦泰方治療VD大鼠的重要藥效途徑，主要與凋亡途徑、調(diào)節(jié)炎癥和免疫信號(hào)通路（NOD-like receptor signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway）密切相關(guān)，而Cluster2主要與核糖體、核蛋白體轉(zhuǎn)運(yùn)及細(xì)胞對(duì)神經(jīng)生長(zhǎng)因子刺激的反應(yīng)有關(guān)。圖3 差異表達(dá)基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]血管性癡呆中醫(yī)治療研究進(jìn)展[J]. 徐再寧,譚文瀾,劉凱模,梁彥啟. 實(shí)用中醫(yī)藥雜志. 2019(06)
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[9]中藥腦泰方對(duì)大鼠腦缺血后VEGF和Angiopoietins表達(dá)的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 宋禎彥,周瑜,王珊珊,龔勝?gòu)?qiáng),劉曉丹,李平,王國(guó)佐. 湖南中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
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博士論文
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碩士論文
[1]腦泰方湯劑和膠囊劑中化學(xué)成分的定量研究[D]. 陳鎮(zhèn).湖南中醫(yī)藥大學(xué) 2005
本文編號(hào)：2903424
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