發(fā)布時(shí)間：2020-11-05 08:29

　　 目的:對(duì)UNC5D基因進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析,保守性分析,轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析,表觀遺傳分析,臨床相關(guān)數(shù)據(jù)計(jì)算及其在腎癌中的共表達(dá)基因信號(hào)通路富集分析,為研究UNC5D在癌癥中檢測(cè)及治療提供參考。方法:通過UCSC基因組瀏覽器、ECR browser、MethPrimer、JASPAR、TCGA、starbase、cBioPortal、DAVID及KEGG等公共數(shù)據(jù)庫和在線工具分析軟件對(duì)UNC5D序列,轉(zhuǎn)錄調(diào)控,表觀遺傳,臨床表達(dá)進(jìn)行整體分析,并通過TCGA數(shù)據(jù)庫利用SPSS軟件具體分析了腎透明細(xì)胞癌患者中UNC5D對(duì)臨床患者生存及分期分級(jí),通過Cbioportal尋找UNC5D在腎透明細(xì)胞癌中的共表達(dá)基因,對(duì)預(yù)測(cè)的基因集進(jìn)行信號(hào)通路富集分析,預(yù)測(cè)UNC5D可能存在的下游信號(hào)通路。結(jié)果:研究表明,人UNC5D基因定位于8p12,其上下游鄰近多個(gè)腫瘤抑制相關(guān)基因。UNC5D基因序列在哺乳動(dòng)物中高度保守,其多個(gè)轉(zhuǎn)錄本可能翻譯出不同蛋白。UNC5D基因主要表達(dá)于成人神經(jīng)系統(tǒng)和泌尿生殖系統(tǒng),且在多種腫瘤中表達(dá)呈明顯下降趨勢(shì),其表達(dá)量的下降可能與啟動(dòng)子區(qū)的高甲基化水平有關(guān)。UNC5D的表達(dá)量差異對(duì)腎癌患者生存存在顯著影響,同時(shí)在臨床相關(guān)參數(shù)中存在顯著差異。腎癌中UNC5D共表達(dá)基因集的信號(hào)通路主要富集在代謝及炎癥相關(guān)通路上。結(jié)論:UNC5D可能在多種癌癥中尤其是腎癌中作為腫瘤抑制因子行使其生物學(xué)功能。
【學(xué)位單位】：中國醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：R737.11
【部分圖文】：

圖 1 UNC5D 上下游相鄰基因示意圖及對(duì)腫瘤相關(guān)基因標(biāo)注3.2 基因保守性分析ECR browser 的在線分析顯示，UNC5D 基因在哺乳動(dòng)物中包括小鼠，狗及恒河猴中的全基因保守性較高，均高于百分之五十,而在低等動(dòng)物中全基因保守性大部分低于百分之五十。（見圖 2）

圖 1 UNC5D 上下游相鄰基因示意圖及對(duì)腫瘤相關(guān)基因標(biāo)注3.2 基因保守性分析ECR browser 的在線分析顯示，UNC5D 基因在哺乳動(dòng)物中包括小鼠，狗及恒河猴中的全基因保守性較高，均高于百分之五十,而在低等動(dòng)物中全基因保守性大部分低于百分之五十。（見圖 2）

6圖 3 縱向?qū)Ρ?UNC5D 核心轉(zhuǎn)錄區(qū)甲基化水平，正負(fù)表觀遺傳信號(hào)水平，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)信號(hào)及預(yù)測(cè)，保守性分析3.4 基因變構(gòu)體分析根據(jù)轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)與蛋白結(jié)構(gòu)及檢測(cè)分析顯示，UNC5D 基因的 7 個(gè)轉(zhuǎn)錄本有 6個(gè)經(jīng)檢測(cè)可以翻譯出蛋白。其中轉(zhuǎn)錄本 1 和轉(zhuǎn)錄本 2 翻譯的蛋白結(jié)構(gòu)域和長度基本相似，長度分別為 953 個(gè)氨基酸和 948 個(gè)氨基酸，有完整的免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域、兩個(gè)血小板反應(yīng)蛋白類結(jié)構(gòu)域重復(fù)、ZU5 結(jié)構(gòu)域和死亡結(jié)構(gòu)域。轉(zhuǎn)錄本 3（H7BXJ2）、轉(zhuǎn)錄本 4（C9J2B6）、轉(zhuǎn)錄本 5（C9J1I0）翻譯的蛋白，均缺少血小板反應(yīng)蛋白類結(jié)構(gòu)域，長度分別為 884 個(gè)氨基酸、958 個(gè)氨基酸和 886 個(gè)氨基酸。轉(zhuǎn)錄本 7
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 馬偉杰;張君;;腎癌相關(guān)抑癌基因[J];中國腫瘤生物治療雜志;2014年03期

本文編號(hào)：2871386