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慢性乙型肝炎患者IFN-α治療無應答與肝組織基因表達差異關(guān)系的初步研究

發(fā)布時間:2020-12-03 00:44
  目的:利用基因芯片技術(shù)檢測慢性乙型肝炎患者α干擾素(IFN-α)治療應答者(Rs)和無應答者(NRs)之間肝組織的表達基因差異,探討IFN-α治療慢乙肝無應答的分子機制。方法:采用表達譜基因芯片檢測IFN-α治療前患者肝組織的全基因表達情況,篩選出在7例治療無應答者和6例治療應答者之間差異表達的基因,對這些差異基因進行Gene Ontology分析和KEGG通路分析,并對部分明顯差異表達基因進行實時熒光定量PCR驗證。結(jié)果:在NRs和Rs組共篩選出3592個差異表達基因(P <0 .05),而這些差異基因主要集中在干擾素誘導基因(ISGs)和免疫調(diào)節(jié)相關(guān)基因,且ISGs在治療前的NRs高表達而免疫調(diào)節(jié)相關(guān)基因低表達。其中,處于一條抑制干擾素信號通路的兩個ISGs(USP18和CEB1)在NRs高表達,而具有潛在抗病毒活性的ISG20基因在NRs低表達,這可能和IFN-α治療無應答密切相關(guān)。結(jié)論:NRs和Rs在IFN-α治療前即具有不同的肝臟基因表達譜,在治療前高表達具有抑制IFN通路的ISGs并抑制免疫反應將預示著治療無應答,并可望在治療前成功預測IFN-α治療效果。 

【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市

【文章頁數(shù)】:49 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

慢性乙型肝炎患者IFN-α治療無應答與肝組織基因表達差異關(guān)系的初步研究


熒光標記反應示意圖

電泳圖,電泳圖,聚類,遺傳聚類


圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Image異表達基因篩選結(jié)果 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P 值和 FDR 均<0.05,數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs 組高表達,而 2036達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)這 3592 個差分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組是另一個聚類(見圖可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異的。

分析圖,遺傳聚類,無監(jiān)督,分析圖


圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差異表達基因篩選結(jié)果在 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P差異倍數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs因低表達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析因可以分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組因此,可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異

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本文編號:2895713

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