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偏最小二乘優(yōu)化及其在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-21 05:40
【摘要】:中醫(yī)藥物質(zhì)基礎(chǔ)研究是中醫(yī)藥現(xiàn)代化的重要內(nèi)容,通常采用高效液相和質(zhì)譜聯(lián)用儀來(lái)獲取實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。此類實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)通常包含成千上萬(wàn)種物質(zhì),呈現(xiàn)出高維數(shù)據(jù)特點(diǎn);同時(shí)由于實(shí)驗(yàn)樣本數(shù)的限制,呈現(xiàn)出小樣本的特點(diǎn)。中醫(yī)方藥在治病的過(guò)程中,往往呈現(xiàn)出多成分、多療效以及非線性的特性,而中醫(yī)藥實(shí)驗(yàn)過(guò)程復(fù)雜、時(shí)間長(zhǎng)、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限以及一些客觀因素造成的實(shí)驗(yàn)誤差等原因,導(dǎo)致有效實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)樣本較少。中醫(yī)藥領(lǐng)域的數(shù)據(jù)的復(fù)雜性使其難以直接使用傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法進(jìn)行分析。因而,需要對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行適當(dāng)?shù)奶幚?使其能夠適用于傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析模型。本文主要是基于偏最小二乘的優(yōu)化對(duì)中醫(yī)藥數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,偏最小二乘的優(yōu)化主要從特征選擇、非線性特征提取和回歸模型的非線性改進(jìn)三方面著手。本文所做的主要工作有:(1)提出了一種基于特征相關(guān)的偏最小二乘特征選擇方法。針對(duì)傳統(tǒng)的偏最小二乘法只考慮單特征的重要性以及特征之間存在冗余和多重共線性等問(wèn)題,將特征之間的統(tǒng)計(jì)相關(guān)性引入到傳統(tǒng)的偏最小二乘分析中,構(gòu)造了一種基于特征相關(guān)的偏最小二乘模型。首先利用特征相關(guān)度對(duì)特征進(jìn)行評(píng)估預(yù)選出特征組,然后將其放入偏最小二乘模型中進(jìn)行訓(xùn)練,評(píng)估該特征組是否可取。結(jié)合前向貪心搜索策略依次評(píng)價(jià)候選特征,并選中使目標(biāo)函數(shù)最小的候選特征加入到已選特征。分別采用麻杏石甘湯君藥止咳、平喘和UCI數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析處理,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該特征選擇方法能較好尋找較優(yōu)的特征組。(2)提出一種融合隨機(jī)森林的偏最小二乘法方法。針對(duì)偏最小二乘法的線性本質(zhì),而隨機(jī)森林算法組合多個(gè)分類器,具有自適應(yīng)性,適合非線性回歸。將偏最小二乘法外模型中的提取的自變量主成分和原始因變量構(gòu)建隨機(jī)森林,根據(jù)殘差信息遞歸建樹(shù),直到滿足事先設(shè)定的條件為止。在麻杏石甘湯君藥平喘實(shí)驗(yàn)、麻杏石甘湯君藥止咳實(shí)驗(yàn)和UCI機(jī)器學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)集上進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)分析,結(jié)果表明,融入隨機(jī)森林的偏最小二乘法能較好表達(dá)中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的特征,提高非線性數(shù)據(jù)的預(yù)測(cè)精度。(3)提出一種基于深度置信網(wǎng)絡(luò)的偏最小二乘法優(yōu)化方法。針對(duì)偏最小二乘內(nèi)部采用的交叉核驗(yàn)方法會(huì)導(dǎo)致主成分急劇減少,從而降低回歸方程的精度,而中醫(yī)藥數(shù)據(jù)對(duì)主成分的選取尤為敏感。該方法主要是利用深度學(xué)習(xí)模型抽取原始數(shù)據(jù)的上層特征,將抽取的特征放入偏最小二乘模型進(jìn)行多元線性回歸,在規(guī)避對(duì)主成分的個(gè)數(shù)選取問(wèn)題的同時(shí),還反應(yīng)了中醫(yī)藥數(shù)據(jù)中所包含的非線性結(jié)構(gòu)。分別采用大承氣湯實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和UCI數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,基于深度置信網(wǎng)絡(luò)的偏最小二乘分析方法對(duì)中醫(yī)藥數(shù)據(jù)有很好的適應(yīng)性。(4)針對(duì)參附注射液治療心源性休克的物質(zhì)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)展開(kāi)分析,首先將原始數(shù)據(jù)的內(nèi)源性物質(zhì)和外源性物質(zhì)區(qū)分開(kāi),使用單因素方差分析對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,去掉那些取值變化小的特征,采用十一種有監(jiān)督的單變量特征選擇方法,對(duì)剩余的內(nèi)源性物質(zhì)進(jìn)行特征重要性排序,取重要特征的交集。再利用無(wú)監(jiān)督的特征選擇方法去除冗余特征。將所得特征集合作為生物標(biāo)記物(內(nèi)源性物質(zhì))。最后,通過(guò)所得的生物標(biāo)記物分析外源性和內(nèi)源性物質(zhì)之間的關(guān)系。(5)在基于以上研究成果的基礎(chǔ)上,按照中醫(yī)藥領(lǐng)域的數(shù)據(jù)分析需求,采用PYTHON相關(guān)編程語(yǔ)言和開(kāi)發(fā)工具,設(shè)計(jì)并開(kāi)發(fā)了中醫(yī)藥數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。
【圖文】:

房?jī)r(jià),預(yù)測(cè)圖,過(guò)擬合,懲罰項(xiàng)


圖 2.1 房?jī)r(jià)真實(shí)預(yù)測(cè)圖 圖 2.2 房?jī)r(jià)過(guò)擬合預(yù)測(cè)圖0 1 2 2 13 13θ + θ x + θ x + ...+ θx(6)0 1 2 2 3 3 4 4 13 13θ + θ x + θ x + θ x + θ x ...+ θx(7)可以看出,左圖擬合較為合適,而右圖過(guò)擬合。如果想要解決右圖中的過(guò)擬合問(wèn)題,需要3 4x ,x 能夠使得的參數(shù)3 4θ ,θ ,盡量滿足3 4θ ≈ 0, θ≈ 0。而如何使得3 4θ ,θ 盡可能接近 0 呢?那就是對(duì)參數(shù)施懲罰項(xiàng)。線性回歸的代價(jià)函數(shù):21( ) (12( ) )ni iiJ h x ymθθ== (8)施加懲罰項(xiàng)之后,公式為:2 21 0( ) ( ) )12(n ki i ji jJ h x ymθθ λ θ= == + (9)梯度下降的式子變?yōu)椋?

過(guò)擬合,房?jī)r(jià),預(yù)測(cè)圖,懲罰項(xiàng)


圖 2.1 房?jī)r(jià)真實(shí)預(yù)測(cè)圖 圖 2.2 房?jī)r(jià)過(guò)擬合預(yù)測(cè)圖0 1 2 2 13 13θ + θ x + θ x + ...+ θx(6)0 1 2 2 3 3 4 4 13 13θ + θ x + θ x + θ x + θ x ...+ θx(7)可以看出,,左圖擬合較為合適,而右圖過(guò)擬合。如果想要解決右圖中的過(guò)擬合問(wèn)題,需要3 4x ,x 能夠使得的參數(shù)3 4θ ,θ ,盡量滿足3 4θ ≈ 0, θ≈ 0。而如何使得3 4θ ,θ 盡可能接近 0 呢?那就是對(duì)參數(shù)施懲罰項(xiàng)。線性回歸的代價(jià)函數(shù):21( ) (12( ) )ni iiJ h x ymθθ== (8)施加懲罰項(xiàng)之后,公式為:2 21 0( ) ( ) )12(n ki i ji jJ h x ymθθ λ θ= == + (9)梯度下降的式子變?yōu)椋?
【學(xué)位授予單位】:江西中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R285;TP181

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