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參麥飲改善糖尿病腎病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究及實驗驗證

發(fā)布時間:2020-12-01 15:20
  目的:利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)結(jié)合動物實驗驗證,探討參麥飲改善糖尿病腎。―iabetic Nephropathy,DN)可能的作用靶點與作用機(jī)制。方法:利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺數(shù)據(jù)庫(TCMSP)、中醫(yī)百科全書平臺(ETCM)收集參麥飲中紅參、麥冬的化學(xué)成分。通過整合藥物靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(TTD)、Drugbank數(shù)據(jù)庫、疾病基因與突變位點數(shù)據(jù)庫(DisGeNET)篩選出DN相關(guān)的靶標(biāo)建立靶點信息。運用蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(STRING)平臺構(gòu)建靶蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI),將PPI網(wǎng)絡(luò)導(dǎo)入Cytoscape軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析,篩選出關(guān)鍵靶點,利用功能注釋生物信息學(xué)分析平臺(DAVID)數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵靶點進(jìn)行基因本體論(GO)富集分析及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析;運用Cytoscape 3.2.1軟件構(gòu)建化合物-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)。造模糖尿病腎病大鼠模型,參麥飲干預(yù)6 w后檢測大鼠的血糖(FBG)、24 h微量白蛋白(mAlb)、血尿素氮(BUN)、血肌酐(Scr)。腎組織使用蛋白免疫印跡法(Western blot)驗證預(yù)測信號通路。結(jié)果:利用網(wǎng)絡(luò)合并及網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析... 

【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020年04期 第81-87頁 北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

參麥飲改善糖尿病腎病的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究及實驗驗證


參麥飲與糖尿病腎病的韋恩圖

活性成分,富集


GO富集分析了關(guān)鍵靶點的功能分布,根據(jù)P值升序選取前15個GO分析條目,GO生物過程(Biological process)主要涉及的生物過程包括正向調(diào)控蛋白質(zhì)磷酸化、一氧化氮生物合成、RNA聚合酶II啟動子的轉(zhuǎn)錄、負(fù)調(diào)控細(xì)胞凋亡過程、調(diào)節(jié)JAK-STAT級聯(lián)參與生長激素信號通路、調(diào)節(jié)磷脂酰肌醇3-激酶信號等;Cellular component(細(xì)胞組分)與核質(zhì)、胞核、細(xì)胞間黏連相關(guān)性最大;Molecular fuction(分子功能)與蛋白結(jié)合、酶結(jié)合相關(guān)性最大,見圖2。2.3.2 參麥飲活性成分治療DN KEGG通路分析

氣泡圖,靶點,活性成分,氣泡圖


利用Cytoscape 3.2.1軟件構(gòu)建候選化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)、通路-靶點網(wǎng)絡(luò),利用軟件中 merge功能,進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)合并得到“化合物-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)圖,如圖(4)。該網(wǎng)絡(luò)包括80個節(jié)點,251條邊,參與該網(wǎng)絡(luò)的紅參活性成分19個,麥冬活性成分28個,作用的靶點13個,富集的通路30個。計算參麥飲活性化合物的度值,以度值為標(biāo)準(zhǔn),篩選出節(jié)點度值大于等于中位數(shù)2的化合物,其中紅參16個,麥冬23個,見表2。這些候選化合物可能在參麥飲改善糖尿病腎病起著重要作用。紅參與麥冬之間存在1個化合物與多個靶點之間的相互作用,同時也可能存在不同化合物共同作用于同1個靶點的現(xiàn)象,這充分體現(xiàn)了中藥多成分與多靶點之間共同作用的機(jī)制。圖4 參麥飲的“活性成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:2894914

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