2017—2018年常州市甲型H3N2流感病毒血凝素基因特征分析
發(fā)布時間:2024-06-11 00:28
目的了解2017—2018年江蘇省常州地區(qū)H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的流行特征和變異情況。方法收集2017年4月至2018年3月常州市流感監(jiān)測哨點醫(yī)院采集的流感樣病例咽拭子標(biāo)本,用實時熒光定量RT-PCR的方法檢測流感病毒核酸,H3N2陽性標(biāo)本進行病毒分離,獲得毒株后進行HA基因擴增和測序。結(jié)果在2017年4月至2018年3月間共分離獲得28株甲型H3N2流感病毒毒株,經(jīng)基因測序后構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,發(fā)現(xiàn)其全部屬于Group3C.2a,與同期疫苗株A/Hong Kong/4801/2014類似。將常州市分離的甲型H3N2流感病毒株與A/Hong Kong/4801/2014疫苗株在HA氨基酸序列上進行差異分析,發(fā)現(xiàn)常州分離的流行毒株在HA抗原決定簇(A-E)區(qū)域,有10個氨基酸位點突變,在HA抗原的莖部區(qū)域有2個氨基酸位點突變。結(jié)論 2017年4月至2018年3月間常州市流行的H3N2流感病毒與同期疫苗株A/Hong Kong/4801/2014(group 3C.2a)分布在同一進化分枝上,呈現(xiàn)1個基因亞組為主流的流行趨勢,但HA抗原決定簇有部分氨基酸...
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 標(biāo)本來源
1.1.2 主要試劑與儀器
1.2 方法
1.2.1 流感病毒核酸檢測及分離培養(yǎng)
1.2.2 H3N2流感病毒HA基因擴增及測序
1.2.3 H3N2流感病毒HA基因系統(tǒng)進化樹分析
1.2.4 H3N2流感病毒氨基酸抗原表位分析
1.2.5 HA蛋白糖基化位點預(yù)測分析
2 結(jié) 果
2.1 HA基因進化分析
2.2 甲型H3N2流感病毒HA蛋白抗原表位分析
2.3 甲型H3N2流感病毒HA蛋白N-糖基化位點預(yù)測分析
3 討 論
本文編號:3992126
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1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 標(biāo)本來源
1.1.2 主要試劑與儀器
1.2 方法
1.2.1 流感病毒核酸檢測及分離培養(yǎng)
1.2.2 H3N2流感病毒HA基因擴增及測序
1.2.3 H3N2流感病毒HA基因系統(tǒng)進化樹分析
1.2.4 H3N2流感病毒氨基酸抗原表位分析
1.2.5 HA蛋白糖基化位點預(yù)測分析
2 結(jié) 果
2.1 HA基因進化分析
2.2 甲型H3N2流感病毒HA蛋白抗原表位分析
2.3 甲型H3N2流感病毒HA蛋白N-糖基化位點預(yù)測分析
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