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RNA甲基化酶TRDMT1基因敲除及其功能初探

發(fā)布時間:2024-07-02 21:54
  RNA甲基化作為一種表觀遺傳標(biāo)記,在基因調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。至今為止,已發(fā)現(xiàn)RNA存在著100多種修飾,其中甲基化是主要的修飾形式,6-甲基腺嘌呤(m6A)和5-甲基胞嘧啶(m5C)是最具有代表性的兩種甲基化修飾。有研究表明RNAm5C修飾在生物體的發(fā)育以及癌癥的發(fā)生中起重要作用。最初被認(rèn)為是DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的TRDMT1(tRNA aspartic acid methyltransferase 1)近十年來被證實是RNA m5C甲基轉(zhuǎn)移酶,催化tRNA產(chǎn)生5-甲基胞嘧啶修飾。最近有研究發(fā)現(xiàn)TRDMT1基因?qū)ζ鞴傩纬、生物體的發(fā)育以及疾病的發(fā)生有影響。然而,對TRDMT1調(diào)控這些過程的分子機(jī)制尚不清楚。本研究利用CRISPR/Cas9誘導(dǎo)的同源重組技術(shù)在RNA甲基化酶TRDMT1基因的轉(zhuǎn)錄起始位點上敲入轉(zhuǎn)錄終止序列BGH ploy(A),終止TRDMT1的表達(dá)從而達(dá)到敲除的目的。通過構(gòu)建TRDMT1敲除的HEK293細(xì)胞系,研究TRDMT1去表達(dá)對細(xì)胞表型以及其他基因表達(dá)的影響,從而了解TRDMT1基因的功能,為研究RNAm5C甲基化的功能提供新思路。主要的研究方法與結(jié)果如下:1、建...

【文章頁數(shù)】:78 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1?CRISPR7Cas9系統(tǒng)的作用原理(引用)??Fig.?1-1?The?principle?of?action?of?CRISPR/Cas9?system??

圖1-1?CRISPR7Cas9系統(tǒng)的作用原理(引用)??Fig.?1-1?The?principle?of?action?of?CRISPR/Cas9?system??

被改編為一個基因編輯工具,改造后的系統(tǒng)包含兩部分:向?qū)В遥危?(single?guide?RNA,??sgRNA)和Cas9蛋白。sgRNA是人工合成的一段能夠識別目標(biāo)序列的RNA序列,其中包??含招募Cas9蛋白的crRNA-tracrRNA復(fù)合體的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。作用原理如圖1-1....


圖2-1?gRNA和檢測引物位置示意圖??.-

圖2-1?gRNA和檢測引物位置示意圖??.-

2.2.1獲得同源重組片段LOXN-Puro??利用PCR的方法在Puro-BGH?poly?(A)片段5’端添加T2A和LOXN序列,構(gòu)建同源??重組片段LOXN-Puro?(圖2-2)。以pSMPUW-IRES-Puro載體為模板,使用高保真酶(Phanta???Super-....


圖2-2LC)RN-Pwo結(jié)構(gòu)以及PCR引物位置示意圖

圖2-2LC)RN-Pwo結(jié)構(gòu)以及PCR引物位置示意圖

圖2-1?gRNA和檢測引物位置示意圖??Fig.2-1?Schematic?diagram?of?gRNA?and?primer?position??2.2構(gòu)建TRDMTl-LOXN-Puro同源重組載體??2.2.1獲得同源重組片段LOXN-Puro??利用PCR的方法在Pu....


圖2-3?TRDMT1-LR結(jié)構(gòu)以及PCR引物位置示意圖??

圖2-3?TRDMT1-LR結(jié)構(gòu)以及PCR引物位置示意圖??

?2.2.2擴(kuò)增左端同源臂TRDMT1-LR??利用引物擴(kuò)增靶位點左端同源臂TRDMT1-LR?(圖2-3)。具體實驗方法如下:??(1)



本文編號:4000069

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