基于網(wǎng)絡(luò)藥理學分析康艾注射液抗腫瘤作用機制
發(fā)布時間:2025-02-06 18:30
目的:運用網(wǎng)絡(luò)藥理學方法分析康艾注射液抗腫瘤的作用機制。方法:利用中藥系統(tǒng)藥理學技術(shù)平臺(TCMSP)篩選康艾注射液的組成中藥的有效成分及對應(yīng)靶蛋白。利用Cytoscape 3.6.1構(gòu)建康艾注射液有效化合物-靶蛋白網(wǎng)絡(luò)并進行網(wǎng)絡(luò)拓撲學分析。借助STRING在線數(shù)據(jù)庫進行蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建并進行分析。通過生物學信息注釋數(shù)據(jù)庫(DAVID)對靶點進行生物過程(Gene Ontology Biological Process,GO-BP)富集分析及基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。結(jié)果:共獲得83個候選化合物,包含了黃酮類、人參皂苷、苦參堿等有效組分;240個靶點,關(guān)鍵靶點是COX1、COX2、HSP90、TP53、AKT1、JUN等;生物過程條目共250條,涉及轉(zhuǎn)錄翻譯、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞增殖與凋亡過程、免疫反應(yīng)、血管生成等生物過程;KEGG信號通路共127條,其中癌癥通路、PI3K-Akt信號通路、淋巴瘤病毒感染、癌癥中的蛋白聚糖、MAPK信號通路、TNF信號通路、前列腺癌、鈣離子信號通路、癌癥的...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
本文編號:4030726
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圖1 化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)圖
為了更好地探討康艾注射液的作用機制,將240個人類靶點蛋白輸入String數(shù)據(jù)庫,并設(shè)置置信度大于0.9,剔除獨立于網(wǎng)絡(luò)以外的靶點,獲得PPI網(wǎng)絡(luò)(見圖2)。該網(wǎng)絡(luò)共有225個節(jié)點,3984條相互作用關(guān)系,平均度值為35.4。利用Cytohubba插件中的Degree算法篩選出....
圖2 康艾注射液相關(guān)靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)圖
表2化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵節(jié)點及其拓撲學特征節(jié)點名稱節(jié)點類型度值介值中心度節(jié)點名稱節(jié)點類型度值介值中心度M98化合物1490.56079226NCOA2靶點210.03812878M422化合物610.11721417PRKACA靶點....
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