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用單分子磁鑷研究大腸桿菌單鏈結(jié)合蛋白的結(jié)合性質(zhì)

發(fā)布時間:2020-12-04 07:23
  單鏈結(jié)合蛋白(Single-strand DNA binding protein,SSB)可以以很高的親和力結(jié)合單鏈DNA(ssDNA),并可以與許多DNA代謝相關蛋白發(fā)生相互作用,從而起到保護ssDNA產(chǎn)物不被降解,并介導代謝相關蛋白進入相應位置進行反應的功能。大腸桿菌單鏈結(jié)合蛋白(E-coli SSB)是單鏈結(jié)合蛋白中具有代表性的一種,它是一種同源四聚體,每個亞基都可以和ssDNA產(chǎn)生高度親和力并結(jié)合。大腸桿菌SSB存在三種穩(wěn)定的結(jié)合模式,分別結(jié)合65 nt ssDNA、56 nt ssDNA和35 nt ssDNA,分別在不同鹽離子濃度下存在。許多研究者對大腸桿菌SSB這一現(xiàn)象進行了大量的研究,然而,其反應的具體過程以及相關反應系數(shù)仍然沒有被全部揭示。因此,我們利用單分子動力學的方法,結(jié)合單分子磁鑷進行拉力實驗,觀察SSB在拉力下的反應現(xiàn)象,發(fā)現(xiàn)在某個臨界力下,SSB會發(fā)生跳變式結(jié)合/解離現(xiàn)象。我們對這個現(xiàn)象進行了長時間測量,得出其反應系數(shù)以及相應的自由能參數(shù)。我們通過對自由能的修正,還原了拉力為零時大腸桿菌SSB的結(jié)合過程,發(fā)現(xiàn)它是一個由快速地結(jié)合和緩慢地纏繞相組合的過程,表現(xiàn)... 

【文章來源】:中國科學院大學(中國科學院物理研究所)北京市

【文章頁數(shù)】:98 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

用單分子磁鑷研究大腸桿菌單鏈結(jié)合蛋白的結(jié)合性質(zhì)


光鑷裝置示意圖(2)

示意圖,技術,瞬逝場,示意圖


第1章 前言折射率介質(zhì)的光,當入射角增大至某一閾值時,會發(fā)生全內(nèi)反射。當射時,雖然光線全部反射,但在入射界面低折射率介質(zhì)中會形成一個瞬逝場。瞬逝場從界面向低折射率介質(zhì)內(nèi)部傳播距離極短,通常只有或更小,它的場強度存在以下關系(13)。( ) (0) exp( )zI z Id 2 2 21 24 sindn n I(z)為場強度,z 為垂直于入射表面的深度值,d 是穿透深度,由光

順磁性物質(zhì),磁場梯度,對手,手柄


在使用中,一般會使用手柄分子一端連接順磁性物質(zhì)包裹的聚苯乙通過移動或旋轉(zhuǎn)磁鐵可以改變外磁實現(xiàn)對手柄分子的拉伸與扭轉(zhuǎn)(25)。磁力的大小可以由下面公式描述xdBF mdx Bx/dx 為磁場梯度。在實驗中,可以用 2BkTLF x 圖 1.4 磁鑷裝置示意圖(2)Fig 1.4 Diagram of magnetic tweeze


本文編號:2897219

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