南方鲇微生物組的時空異質(zhì)性研究
發(fā)布時間：2020-12-14 11:02
微生物是生態(tài)圈中不可或缺的生命組成部分,它對動物的環(huán)境適應(yīng)和進化起著重要作用。微生物與動物共棲是經(jīng)過長期互作、協(xié)同進化的結(jié)果,它們的關(guān)系是當前生命科學(xué)和生態(tài)科學(xué)共同關(guān)注的前沿問題。在過去10年間,隨著高通量測序技術(shù)和生物信息分析學(xué)的發(fā)展與結(jié)合,很大程度上解決了長期以來腸道微生物難以分離、培養(yǎng)的技術(shù)性難題,如今我們可以逐漸揭示微生物群落多樣性及其功能與動物的關(guān)系,探索微生物群落、宿主和環(huán)境因子的相互影響機制。從宿主微生物的角度出發(fā),圍繞與動物生長發(fā)育密切相關(guān)的宿主和環(huán)境因素開展研究,揭示動物微生物群落的發(fā)展、形成及演替過程,有望進一步了解宿主微生物組的動態(tài)發(fā)展、穩(wěn)定性,以及解析動物健康穩(wěn)態(tài)的維持和適應(yīng)性進化的機制。水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)是我國農(nóng)業(yè)增長最快的一個產(chǎn)業(yè),魚類是重要的水產(chǎn)養(yǎng)殖對象。盡管我國魚類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)比較發(fā)達,但針對與魚類健康密切相關(guān)的腸道微生物研究尚存諸多不足。絕大部分腸道微生物研究的方法相對傳統(tǒng),且沒有針對與養(yǎng)殖密切相關(guān)的重要環(huán)節(jié)(諸如個體發(fā)育、飼料加工方式和漁藥使用等)展開系統(tǒng)的研究。此外,極少數(shù)研究關(guān)注了除腸道以外的魚類其它組織或器官的微生物群落。針對目前的研究不足與薄弱環(huán)節(jié),本論...
【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：171 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
不同種群和進化背景下的人類腸道微生物組（A）不同種群的人類腸道微生物組；（B）靈長類動物譜系背景下的人類腸道微生物；
150種到400種之間，主要由厚壁菌門（Firmicutes），擬桿菌門（Bacteroidetes），放線菌門（Actinobacteria）和變形菌門（Proteobacteria）四種門類微生物組成，前兩者是人類腸道中豐度最高的微生物門類（Lloyd-Price et al 2016）（圖1-2）。盡管構(gòu)成微生物的主要門類相同，但人類本身的腸道微生物組成差異很大。對來自不同國家和地區(qū)的人類腸道微生物進行調(diào)查，都發(fā)現(xiàn)這些相類似的結(jié)果。例如，Tyakht 等（2013）比較俄羅斯人和非俄羅斯人的腸道微生物，發(fā)現(xiàn)厚壁菌門和擬桿菌門在俄羅斯人腸道中的比例分別是64.68%和26.62%，而在非俄羅斯人中分別是40.39%和54.06%。這些微生物的豐度也不同于來自中國多個地區(qū)人群腸道微生物的調(diào)查結(jié)果，在中國人體腸道中，二者的平均豐度分別為73.47%和14.13%（Zhang et al 2015）；根據(jù)調(diào)查地點分組，中國人腸道的厚壁菌門和擬桿菌門的豐度變化也很大，它們的比率在0.5到300.6之間變化。較早之前的哺乳類研究分析了人類和其它59種動物的腸道微生物
微生物的塑造作用（Goodrich et al 2014）。在鼠類中，通過控制相同的養(yǎng)殖條件，研究不同的亞種也得到類似的結(jié)果（Buhnik-Rosenblau et al 2011）。圖1-4 動物母本微生物向后代轉(zhuǎn)移的示例（引自Funkhouser and Bordenstein 2013）Fig. 1-4 Examples of animals that exhibit microbial transmission (Cited from Funkhouser andBordenstein 2013)宿主種類作為一個重要的因子也影響魚類腸道微生物。不同來源的模式動物斑馬魚腸道定植大量相同的 核心菌群 ，主要由變形菌門和梭桿菌門組成，揭示養(yǎng)殖與野生斑馬魚腸道菌群的相似性，強調(diào)宿主對特有微生物種屬的選擇而弱化地理來源地影響（Roeselers et al 2011）。有研究顯示：魚類受精卵內(nèi)可能有母體垂直傳播的細菌，如大馬哈魚（Oncorhyncus keta）受精卵內(nèi)的鮭魚腎桿菌（Renibaeterium
【參考文獻】：
期刊論文
[1]牙鲆(Paralichthys olivaceus)仔稚幼魚腸道菌群結(jié)構(gòu)比較分析[J]. 劉增新,柳學(xué)周,史寶,徐永江,劉權(quán). 漁業(yè)科學(xué)進展. 2017(01)
[2]海水養(yǎng)殖魚類病原微生物研究進展[J]. 陶詩,何芳芳,劉雪珠,何建瑜,王健鑫. 水產(chǎn)科學(xué). 2013(03)
[3]三種室內(nèi)飼養(yǎng)魚類腸道微生物群落PCR-DGGE指紋分析[J]. 李學(xué)梅,余育和,解綬啟,顏慶云,陳宇航,董小林. 水生生物學(xué)報. 2011(03)
[4]淺談魚類消化道微生物的分布及調(diào)控[J]. 孫云章,楊紅玲. 水產(chǎn)科學(xué). 2008(05)
博士論文
[1]養(yǎng)殖大菱鲆腸道微生物多樣性及功能分析[D]. 邢孟欣.中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所） 2013
碩士論文
[1]膽汁酸對草魚生長、脂質(zhì)代謝及腸道微生物區(qū)系的影響[D]. 陳昊杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]基于PCR-DGGE技術(shù)的不同飼喂模式下草魚腸道菌群多樣性分析[D]. 譚情.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]草魚腸道優(yōu)勢菌種的分離、鑒定及對纖維素降解的初步研究[D]. 呂欣榮.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號：2916307
【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：171 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
不同種群和進化背景下的人類腸道微生物組（A）不同種群的人類腸道微生物組；（B）靈長類動物譜系背景下的人類腸道微生物；
150種到400種之間，主要由厚壁菌門（Firmicutes），擬桿菌門（Bacteroidetes），放線菌門（Actinobacteria）和變形菌門（Proteobacteria）四種門類微生物組成，前兩者是人類腸道中豐度最高的微生物門類（Lloyd-Price et al 2016）（圖1-2）。盡管構(gòu)成微生物的主要門類相同，但人類本身的腸道微生物組成差異很大。對來自不同國家和地區(qū)的人類腸道微生物進行調(diào)查，都發(fā)現(xiàn)這些相類似的結(jié)果。例如，Tyakht 等（2013）比較俄羅斯人和非俄羅斯人的腸道微生物，發(fā)現(xiàn)厚壁菌門和擬桿菌門在俄羅斯人腸道中的比例分別是64.68%和26.62%，而在非俄羅斯人中分別是40.39%和54.06%。這些微生物的豐度也不同于來自中國多個地區(qū)人群腸道微生物的調(diào)查結(jié)果，在中國人體腸道中，二者的平均豐度分別為73.47%和14.13%（Zhang et al 2015）；根據(jù)調(diào)查地點分組，中國人腸道的厚壁菌門和擬桿菌門的豐度變化也很大，它們的比率在0.5到300.6之間變化。較早之前的哺乳類研究分析了人類和其它59種動物的腸道微生物
微生物的塑造作用（Goodrich et al 2014）。在鼠類中，通過控制相同的養(yǎng)殖條件，研究不同的亞種也得到類似的結(jié)果（Buhnik-Rosenblau et al 2011）。圖1-4 動物母本微生物向后代轉(zhuǎn)移的示例（引自Funkhouser and Bordenstein 2013）Fig. 1-4 Examples of animals that exhibit microbial transmission (Cited from Funkhouser andBordenstein 2013)宿主種類作為一個重要的因子也影響魚類腸道微生物。不同來源的模式動物斑馬魚腸道定植大量相同的 核心菌群 ，主要由變形菌門和梭桿菌門組成，揭示養(yǎng)殖與野生斑馬魚腸道菌群的相似性，強調(diào)宿主對特有微生物種屬的選擇而弱化地理來源地影響（Roeselers et al 2011）。有研究顯示：魚類受精卵內(nèi)可能有母體垂直傳播的細菌，如大馬哈魚（Oncorhyncus keta）受精卵內(nèi)的鮭魚腎桿菌（Renibaeterium
【參考文獻】：
期刊論文
[1]牙鲆(Paralichthys olivaceus)仔稚幼魚腸道菌群結(jié)構(gòu)比較分析[J]. 劉增新,柳學(xué)周,史寶,徐永江,劉權(quán). 漁業(yè)科學(xué)進展. 2017(01)
[2]海水養(yǎng)殖魚類病原微生物研究進展[J]. 陶詩,何芳芳,劉雪珠,何建瑜,王健鑫. 水產(chǎn)科學(xué). 2013(03)
[3]三種室內(nèi)飼養(yǎng)魚類腸道微生物群落PCR-DGGE指紋分析[J]. 李學(xué)梅,余育和,解綬啟,顏慶云,陳宇航,董小林. 水生生物學(xué)報. 2011(03)
[4]淺談魚類消化道微生物的分布及調(diào)控[J]. 孫云章,楊紅玲. 水產(chǎn)科學(xué). 2008(05)
博士論文
[1]養(yǎng)殖大菱鲆腸道微生物多樣性及功能分析[D]. 邢孟欣.中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所） 2013
碩士論文
[1]膽汁酸對草魚生長、脂質(zhì)代謝及腸道微生物區(qū)系的影響[D]. 陳昊杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]基于PCR-DGGE技術(shù)的不同飼喂模式下草魚腸道菌群多樣性分析[D]. 譚情.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]草魚腸道優(yōu)勢菌種的分離、鑒定及對纖維素降解的初步研究[D]. 呂欣榮.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號：2916307
本文鏈接：http://www.wukwdryxk.cn/nykjlw/scyylw/2916307.html
最近更新
教材專著
