發(fā)布時(shí)間：2020-11-14 17:26

　　 番茄是世界上重要的蔬菜作物。本研究采用表型性狀和SNP標(biāo)記對(duì)收集到的322份番茄種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析。用變異系數(shù)、Shannon-Wiener多樣性指數(shù)對(duì)收集到的322份番茄種質(zhì)資源的29個(gè)表型性狀進(jìn)行遺傳多樣性分析;用SPSS 20.0進(jìn)行聚類(lèi)分析,通過(guò)主成分、相關(guān)性以及回歸分析對(duì)番茄種質(zhì)資源進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和評(píng)價(jià)指標(biāo)篩選。利用KASP技術(shù)對(duì)在表型結(jié)果聚類(lèi)基礎(chǔ)上篩選出的46份代表性材料進(jìn)行SNP基因分型檢測(cè),篩選出多態(tài)性高的SNP標(biāo)記,從篩選出的多態(tài)性引物中挑選均勻覆蓋番茄全染色體的120對(duì)引物對(duì)185份有代表性的供試材料進(jìn)一步進(jìn)行種質(zhì)資源遺傳多樣性分析。主要研究結(jié)果如下:1.供試材料的表型性狀具有豐富的遺傳多樣性,葉片類(lèi)型以普通葉型為主,花梗離層以有離層為主。13個(gè)質(zhì)量性狀共檢測(cè)到40個(gè)變異類(lèi)型,質(zhì)量性狀中Shannon-Wiener多樣性指數(shù)最高的是生長(zhǎng)勢(shì)(1.52);數(shù)量性狀最高的是葉片長(zhǎng)(2.08)和葉片寬(2.07),16個(gè)數(shù)量性狀的變異系數(shù)CV值介于11.71%～70.93%,變異系數(shù)最大的是裂果率(70.93%);遺傳多樣性指數(shù)(H')分布范圍為1.49～2.08。相關(guān)性分析和主成分分析結(jié)果表明:各性狀間存在復(fù)雜的相互關(guān)系,前9個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率為64.58%,包含了全部指標(biāo)的大部分信息。2.表型性狀的綜合評(píng)價(jià)分析表明,編號(hào)為68的番茄D值(0.585)最高,其綜合性能最好;29個(gè)表型性狀與綜合值D之間:除了果肉厚,花柱長(zhǎng)度,葉片形狀和葉色外,均表現(xiàn)為顯著相關(guān)。采用逐步回歸分析方法篩選出20個(gè)性狀可以作為番茄綜合評(píng)價(jià)的重要指標(biāo)。在遺傳距離為17.5處可將供試的322份番茄資源劃分為6個(gè)組群,第5組群包含133份材料,主要特點(diǎn)為圓形,生長(zhǎng)習(xí)性為有限生長(zhǎng);第6組群包含175份,主要特點(diǎn)為單果質(zhì)量小,生長(zhǎng)習(xí)性為無(wú)限生長(zhǎng)。3.基于表型性狀分類(lèi)結(jié)果篩選出46個(gè)有代表性的番茄材料,利用KASP檢測(cè)方法對(duì)374個(gè)SNP標(biāo)記進(jìn)行篩選,結(jié)果表明:75對(duì)無(wú)多態(tài)性,不能區(qū)分樣本的基因型;116對(duì)具有非特異性擴(kuò)增,不能很好的區(qū)分樣本的基因型:183對(duì)SNP引物基因分型結(jié)果好,多態(tài)性高,能夠用于后續(xù)遺傳多樣性分析。4.從篩選出的多態(tài)性引物中挑選均勻覆蓋番茄全染色體的120對(duì)引物對(duì)185份有代表性的供試材料進(jìn)行SNP基因分型,共檢測(cè)到348個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)均檢測(cè)到2.892個(gè)等位變異。等位基因頻率為0.429～0.962之間,平均為0.674;雜合度為0～0.557之間,平均為0.032;多態(tài)性信息含量(PIC)為0.071～0.571,平均值為0.325,主要分布在0.35～0.40之間,表明本研究中SNP標(biāo)記表現(xiàn)為中度偏高多態(tài)性。185份番茄材料間的遺傳距離變異范圍為0.002～1.141之間,平均值為0.528,其中R137與R139之間的遺傳距離最低(0.002),R96與R106之間的遺傳距離最大(1.141)。按照UPGMA法構(gòu)建聚類(lèi)圖,185份番茄材料在遺傳距離為0.25時(shí)可被劃分為4大類(lèi)群。群體遺傳結(jié)構(gòu)分析將番茄種質(zhì)資源劃分為3個(gè)類(lèi)群。以上結(jié)果表明供試材料遺傳多樣性豐富,為未來(lái)番茄育種雜交親本的選擇和新品種選育提供了理論支持。
【學(xué)位單位】：寧夏大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類(lèi)】：S641.2
【部分圖文】：

量檢測(cè)??度的檢測(cè)??儀測(cè)得的番茄葉片ＤＮＡ的濃度和純度，ＤＮＡ樣品的０／Ａ２３０比值均大于２．０，研究表明提取的ＤＮＡ雜質(zhì)表３－４?１０份番茄ＤＮＡ樣品的濃度和純度??ａｂｌｅ３－４?Ｔｈｅ?ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ?ａｎｄ?ｐｕｒｉｔｉｅｓ?ｏｆ?１０?ＤＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｏｆ?ｔｏｍａＡ２６０／Ａ２８０?Ａ２６０／Ａ２３０￣｜?序號(hào)?濃度（ｎｇ／ｐＬ）??????Ｎｏ．?Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ?１．９２２?一１０４８?６?１７８．６０１．９３７?２．２３４?７?２６０．００１．９２３?２．１８０?８?１８６．２１１．９６６?２．２５９?９?２４１．２１Ｌ９２９?２Ｊ０１??１０?１７７．７４泳檢測(cè)??測(cè)（閣３－１）提取到的１０份番茄葉片基因組ＤＮＡ（稀只有１條清晰并且完整的帶，質(zhì)量高，能滿足ＳＮＰ增反應(yīng)。??

代表雜合型的點(diǎn)位于水平軸和垂直軸的交叉區(qū)域》ＮＴＣ分布于橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)交界區(qū)域，圖中每??個(gè)圓點(diǎn)都對(duì)應(yīng)一個(gè)供試番茄材料，每個(gè)引物均會(huì)將供試番茄材料分成三組或兩組，每組帶有不同??顏色，藍(lán)色代表該基因具有ＦＡＭ標(biāo)簽序列，紅色代表該基因具有ＨＥＸ標(biāo)簽序列（圖３－２）。在本??研究中所應(yīng)用的３７４個(gè)ＳＮＰ位點(diǎn)引物中，７５對(duì)無(wú)多態(tài)性，不能區(qū)分樣本的基因型，１１６對(duì)具有非??特異性擴(kuò)增

同時(shí)結(jié)合其表型可以看出，Ｒ１０６為紅果無(wú)限生長(zhǎng)型番茄，而Ｒ９６為粉果有限生長(zhǎng)，兩者??外部差異明顯。??根據(jù)計(jì)算出來(lái)的１７０６３個(gè)遺傳距離，以０．１為組距進(jìn)行次數(shù)分布分析（圖３－４）�？梢钥闯觯�??１８５份番茄材料的遺傳距離在０．５０２－０．６０２之間最多，數(shù)量為５３２５個(gè)，占總數(shù)的３１％，遺傳距離??＞?０．４０２的遺傳距離有１４５３６個(gè)，＜?０．４０２的遺傳距離有２５２７個(gè)，分別占總數(shù)的８５．１９％和１４．８１％，??由此說(shuō)明，供試材料的遺傳距離大，供試材料的差異較大，遺傳基礎(chǔ)好。??－３６－??
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2883746