a国产,中文字幕久久波多野结衣AV,欧美粗大猛烈老熟妇,女人av天堂

當(dāng)前位置:主頁(yè) > 理工論文 > 生物學(xué)論文 >

基于網(wǎng)絡(luò)分析的RNA結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-03 06:14
  核糖核酸(RNA)是細(xì)胞中的基本單元之一,常與其它蛋白質(zhì)或小分子等生物分子形成復(fù)合物結(jié)構(gòu),有調(diào)控和催化等重要的生物學(xué)功能。然而,由于RNA分子的柔性特征和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的限制,實(shí)驗(yàn)上較難快速測(cè)定RNA分子的復(fù)合物結(jié)構(gòu),極大地阻礙了 RNA復(fù)合物功能的探索。因此,RNA結(jié)合位點(diǎn)的理論預(yù)測(cè)研究有助于理解其結(jié)構(gòu)功能關(guān)系和解釋生物學(xué)機(jī)理問(wèn)題。本文介紹了一種基于RNA三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)合位點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)策略,即RBind。該方法首先對(duì)RNA三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建。在網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建中,RNA結(jié)構(gòu)中的每個(gè)核苷酸為網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn),非近鄰核苷酸中任一重原子間距離小于8A連接為網(wǎng)絡(luò)中的邊。第二步,在構(gòu)建的RNA網(wǎng)絡(luò)中,我們對(duì)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)的度中心性和接近中心性進(jìn)行計(jì)算。第三步,基于度中心性(degree)和接近中心性(closeness)的計(jì)算,以一定值作為截?cái)啻_定RNA的結(jié)合位點(diǎn)。進(jìn)一步,我們用RNA-ligand和RNA-protein測(cè)試集對(duì)RBind的精度進(jìn)行了比較分析。結(jié)果表明,該方法在RNA-ligand測(cè)試集中的平均預(yù)測(cè)精度為0.82,在RNA-protein測(cè)試集中的平均預(yù)測(cè)精度為0.63,預(yù)測(cè)精度優(yōu)于現(xiàn)有的RNA結(jié)... 

【文章來(lái)源】:華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 RNA簡(jiǎn)介
        1.1.1 RNA結(jié)構(gòu)特征
        1.1.2 RNA功能特征
        1.1.3 RNA復(fù)合物的結(jié)構(gòu)與功能特征
    1.2 結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)的研究進(jìn)展及意義
        1.2.1 研究進(jìn)展
        1.2.2 研究意義
    1.3 本文的研究工作及章節(jié)安排
        1.3.1 本文的研究工作
        1.3.2 章節(jié)安排
第二章 研究方法
    2.1 RBind網(wǎng)絡(luò)模型
        2.1.1 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
        2.1.2 局部特征與全局特征
    2.2 RNA三級(jí)結(jié)構(gòu)建模
        2.2.1 序列與二級(jí)結(jié)構(gòu)介紹
        2.2.2 模型搭建
    2.3 直接耦合分析模型
    2.4 軟件介紹
        2.4.1 MATLAB
        2.4.2 Pymol
    2.5 本章小結(jié)
第三章 研究結(jié)果
    3.1 引言
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 測(cè)試集選取及結(jié)果分析方法
        3.2.2 測(cè)試集中的預(yù)測(cè)結(jié)果分析
        3.2.3 建模結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)結(jié)果分析
        3.2.4 與現(xiàn)有方法的比較
        3.2.5 共進(jìn)化關(guān)系
    3.3 潛在應(yīng)用分析
        3.3.1 藥物設(shè)計(jì)的靶標(biāo)
        3.3.2 復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    3.4 本章小結(jié)
第四章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
攻讀學(xué)位期間獲得的獎(jiǎng)勵(lì)
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]核酸分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究[D]. 王劍.華中科技大學(xué) 2017
[2]非編碼RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究[D]. 趙蘊(yùn)杰.華中科技大學(xué) 2012



本文編號(hào):2896119

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://www.wukwdryxk.cn/projectlw/swxlw/2896119.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶(hù)bcbf1***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com
精品无码久久久久成人漫画| 国产精品美女久久久久AV福利| 91丨九色丨国产| 真实国产乱子伦xxxx| 免费无码又爽又刺激高潮| 人人妻人人爽人人澡AV| 四虎影视在线播放| 国产精品污www一区二区三区| 丰满爆乳无码一区二区三区| 无码人妻丰满熟妇区五十路百度| 伊人久久综合精品无码AV专区| 播播影院| 蜜桃视频官网| 毛片过| 国产麻豆综合视频在线观看| 免费又大粗又爽又黄少妇毛片| 人妻在线日韩免费视频| 国产aⅴ无码专区亚洲av麻豆| 精品国产肉丝袜久久| 日韩精品无码一区二区忘忧草| 超碰夫妻| 美女18免费| 91精品国产自产91精品| 公的大龟慢慢挺进我的体内视频| 久久久久久久无码高潮| 真实的和子乱拍在线观看| 国产精品久久久久久精品三级| 黑色丝袜自慰喷水网站| 亚洲精品TY久久久久久久久久| 激情天堂| 下面一进一出好爽视频| 人妻激情综合久久久久| 夜夜澡狠狠澡2015| 影院午夜精品久久久久久99热| 亚洲精品国产品国语在线app| 色欲aⅴ亚洲情无码AV| 亚洲色大成永久ww网站| 少妇的丰满3中文字幕| 久久这里有精品免费下载| 国产一区二区三区乱码在线观看 | 一本大道久久东京热无码AV|