發(fā)布時間：2025-06-27 04:36

　　 為深入研究狗棗獼猴桃AkKCS蛋白功能,利用生物信息學(xué)方法,對其蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、親水/疏水性和功能結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析。結(jié)果表明:狗棗獼猴桃AkKCS蛋白cDNA全長為1 693bp,共編碼496個氨基酸,為親水性、不穩(wěn)定蛋白質(zhì),具有KCS超家族的保守結(jié)構(gòu)域(ID:PLN03212),AkKCS氨基酸序列與中華獼猴桃原變種親緣關(guān)系較近,與煙草等12種其他植物親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

【文章頁數(shù)】：3 頁

【部分圖文】：

圖1 狗棗獼猴桃AkKCS蛋白的等電點(diǎn)

對AkKCS氨基酸序列預(yù)測結(jié)果表明，AkKCS蛋白開放閱讀框?yàn)?693bp，編碼496個氨基酸，分子式為C2533H4038N680O691S28，分子量55971Da，理論pI為9.33，不穩(wěn)定指數(shù)為40.75，脂肪系數(shù)為99.07，親水性平均水平0.011。AkKCS蛋白....

圖2 狗棗獼猴桃AkKCS蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測

NCBI-CDD序列的比對結(jié)果（圖3）表明，狗棗獼猴桃AkKCS蛋白為3-酮脂酰-CoA合酶KCS基因家族的成員（ID:PLN03212）之一，其保守結(jié)構(gòu)域及功能位點(diǎn)位于第80～454氨基酸之間的序列區(qū)域，第80～368氨基酸之間含有FAE1合酶保守結(jié)構(gòu)及其他查爾酮合酶保守結(jié)構(gòu)域....

圖3 狗棗獼猴桃AkKCS蛋白的保守序列

圖2狗棗獼猴桃AkKCS蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測2.4AkKCS蛋白的二級、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測

圖4 狗棗獼猴桃AkKCS蛋白的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測

對AkKCS蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明，螺旋（Helix）為該蛋白的主要結(jié)構(gòu)，占比50.2%；無規(guī)卷曲（Randomcoil）占比31.45%，延伸鏈（Strand）占比13.31%,5.04%為轉(zhuǎn)角（Turn）結(jié)構(gòu)，沒有特殊結(jié)構(gòu)。對AkKCS蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果（圖4）表明，....

本文編號：4053818