發(fā)布時間：2025-03-17 21:30

　　 目的預測潛在的γ-和β-珠蛋白表達調控因子,為珠蛋白基因表達調控研究提供新的思路。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中下載γ-和β-珠蛋白基因差異表達相關的兩組RNA-seq數(shù)據(jù),利用分化各時期共同存在的不同組織來源細胞間的差異表達基因及其預測出的上游調控因子,通過STRING數(shù)據(jù)庫、Centiscape軟件進行潛在調控因子的預測。結果除預測到BCL11A、NF-E2、YY1和GATA1等已知的γ-和β-珠蛋白基因表達調控因子外,從兩組數(shù)據(jù)共同預測出14個潛在調控因子。結論分析預測出的包括MAPK1、TNF和IFNG等潛在的調控因子可能調控γ-和β-珠蛋白基因表達,需要近一步的分子生物學實驗證實。

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

圖1外周血與胎肝來源間差異表達基因及上游調控因子間的蛋白質間相互作用網(wǎng)絡圖Fig1Protein-proteininteractionnetworkofdifferentiallyexpressedgenesandupstreamregulatorsderivedfromperipheralbloodandfetalliver

基礎醫(yī)學與臨床Basic＆ClinicalMedicine2018.38(11)行上游調控因子的預測，共預測出30個，如表2所示前20個。2.3γ-和β-珠蛋白基因表達調控因子的預測過STＲING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape對外周血與胎肝來源間不同分化時期共有的635個差異表達基因....

圖２胎肝期Ｙ－珠蛋白向成年型ｐ－珠蛋白基因表達轉換的調控網(wǎng)絡示意圖??眾多轉錄因子和輔助因子參與到了胎肝期７－珠蛋白向Ｐ－珠蛋白基因表達轉換過程中

使ＬＣＲ與ｙ－珠蛋白基因啟動子相互靠近；在成年期紅細胞中，ＬＣＲ會與Ｐ－珠??蛋白基因啟動子相互靠近［２２］。??如圖２所示，眾多調控Ｙ－和（３－珠蛋白基因表達的轉錄因子并不是獨立地調控??珠蛋白基因表達，而是各因子間相互協(xié)調，在多層次的調控網(wǎng)絡中發(fā)揮調控功??能。??Ｉ??丄?....

圖３本研究實驗設計的技術路線圖??

圖３本研究實驗設計的技術路線圖??

圖６紅系分化第１１天和第１４天外周血與胎肝來源細胞間差異表達基因的篩選和聚類分析??（Ａ）分化第〗１天，外周血與胎肝來源相比有４０９個基因表達上調，３１７個基因表達下??調；分化第１１天，外周血與胎肝來源相比有７１８個基因表達上調，７９８個基因表達下調??（Ｂ）?（Ｃ）利用紅系分化第１１天和第１４天的外周血與胎肝來源間的差異表達基因繪制??熱圖和韋?

圖６紅系分化第１１天和第１４天外周血與胎肝來源細胞間差異表達基因的篩選和聚類分析??（Ａ）分化第〗１天，外周血與胎肝來源相比有４０９個基因表達上調，３１７個基因表達下??調；分化第１１天，外周血與胎肝來源相比有７１８個基因表達上調，７９８個基因表達下調??（Ｂ）?（Ｃ）利用紅系分....

本文編號：4035497