一株ST477型單增李斯特菌的全基因組測序及inlA基因遺傳多樣性
發(fā)布時間:2024-05-11 05:12
【背景】單增李斯特菌是一種重要的條件致病菌,不同型別菌株在宿主范圍和毒力等方面存在差異。內化素基因inlA在入侵宿主上皮細胞中具有重要作用!灸康摹垦芯繂卧隼钏固鼐蛄行(Sequence type,ST)為477菌株的基因組特征及內化素基因inlA的遺傳多樣性!痉椒ā渴褂孟嚓P軟件對測序數據進行多位點序列分型(Mutilocussequencetyping,MLST)、單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)及基因inlA遺傳多樣性分析。【結果】MLST進化分析結果顯示,分離自不同國家的菌株具有較近親緣關系。以分離自中國食品的ST477型菌株為參考菌株,通過SNP分析表明,加拿大食品中的ST9型菌株發(fā)生的突變位點最少(91-93個)。7株復合克隆系(Clonal complex,CC)為9的菌株其inlA基因序列間核苷酸相似性為29.8%-100%。【結論】初步分析了ST477型別菌株的進化及基因組特征,同時研究了部分CC9克隆系菌株inlA基因突變情況,為研究ST477型別菌株的進化及單增李斯特菌的毒力提供基礎數據。
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【部分圖文】:
本文編號:3969571
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圖2單增李斯特菌MLST聚類分析圖Figure2MLSTgeneticprofileofL.monocytogenesisolates
1104微生物學通報Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn圖2單增李斯特菌MLST聚類分析圖Figure2MLSTgeneticprofil....
圖3基于7株單增李斯特菌全基因組SNPs進化分析Figure3Phylogeneticanalysisof7L.monocytogeneswholegenomeSNPs
),一株ST9型與ST122型菌株聚為另一大類群(GroupII)。雖然目前沒有明確的SNP標準規(guī)定菌株進化關系,但ST477菌株與3株來自加拿大食品菌株的SNP差異數最少,說明其親緣關系較近。該結果與Zhang等[22]對分離自上海的單增李斯特菌基因組多樣性進行研究的結果相似:....
圖4基于7個單增李斯特菌的inlA序列的最大似然樹Figure4Maximumlikelihoodtreeof7L.monocytogenes
1106微生物學通報Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn圖4基于7個單增李斯特菌的inlA序列的最大似然樹Figure4Maximumli....
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