發(fā)布時(shí)間：2024-06-29 06:28

　　目的探討淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯敏感品系與抗性種群成蚊腸道菌群多樣性和組成結(jié)構(gòu)。方法分離淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯敏感品系與抗性種群成蚊腸道并提取總基因組DNA,對(duì)敏感品系與抗性種群成蚊腸道菌群16S rDNA基因的V3+V4區(qū)進(jìn)行測(cè)序,分析其物種組成結(jié)構(gòu)、菌群多樣性及相對(duì)豐度;通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)技術(shù)驗(yàn)證細(xì)菌相對(duì)豐度以檢測(cè)測(cè)序數(shù)據(jù)的可靠性。結(jié)果通過(guò)優(yōu)化剪切得到216 022條有效序列,根據(jù)序列相似性進(jìn)行聚類分析共獲取766個(gè)操作分類單元,分別注釋到31個(gè)門,62個(gè)綱,132個(gè)目,215個(gè)科和339個(gè)屬。樣本覆蓋度均接近99%,表明測(cè)序量基本覆蓋所有細(xì)菌物種。敏感品系的Chao1指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)和辛普森指數(shù)分別為374.53±40.27、2.56±0.59和0.36±0.11,抗性種群分別為201.58±29.34、1.14±0.13和0.55±0.07。淡色庫(kù)蚊敏感品系與抗性種群腸道菌群均以變形菌門和厚壁菌門居多;在目分類水平上,敏感品系的優(yōu)勢(shì)菌目分別為紅螺菌目、腸桿菌目及伯克霍爾德氏菌目,而抗性種群的優(yōu)勢(shì)菌目為紅螺菌目、氣單胞菌目及乳酸桿菌目;在屬分類水平上,敏感品系的優(yōu)勢(shì)菌屬為未...

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【部分圖文】：

圖1淡色庫(kù)蚊敏感品系與抗性種群腸道的OTUs分布維恩圖

通過(guò)IlluminaMiSeq高通量測(cè)序?qū)γ舾衅废蹬c抗性種群腸道細(xì)菌16SrDNA基因V3+V4可變區(qū)進(jìn)行測(cè)序分析，共產(chǎn)生435843條原始序列，經(jīng)過(guò)兩端序列拼接優(yōu)化后得到216022條有效序列。樣本中99.99%的序列在400～600bp之間，平均長(zhǎng)度為429b....

圖2稀釋曲線和Rank-abundance曲線

通過(guò)隨機(jī)抽取測(cè)序序列與其所代表的OTU數(shù)目繪制稀釋曲線來(lái)分析測(cè)序數(shù)據(jù)的飽和程度（圖2），結(jié)果顯示，隨著測(cè)序深度加深，敏感品系腸道測(cè)序的稀釋曲線趨于平緩并接近飽和，表明獲得的測(cè)序量能夠客觀反映敏感品系腸道的所有細(xì)菌類群；抗性種群的稀釋曲線在97%相似水平下曲線斜率逐漸降低，但尚未完....

圖3非度量多維標(biāo)度（NMDS）圖

圖2稀釋曲線和Rank-abundance曲線2.3敏感品系與抗性種群腸道菌群的種類組成及相對(duì)豐度

圖4敏感品系與抗性種群腸道菌群相對(duì)豐度

在目分類階元水平上（圖4B），敏感品系中腸道菌群相對(duì)豐度最高的前3位依次為紅螺菌目（Rhodospirillales）、腸桿菌目（Enterobacteriles）及伯克霍爾德氏菌目（Burkholderiales），其相對(duì)豐度分別為（65.92±8.94）%、（3.20±1.1....

本文編號(hào)：3997305