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青海同德藏族人群感染乙肝病毒基因型及變異的初步研究

發(fā)布時間:2020-11-09 06:34
   目的:了解青海省同德縣藏族自然人群感染乙肝病毒(HBV)基因型、血清亞型分布特征,并初步分析基因型與臨床類型之間的關(guān)系;了解青海省同德縣藏族自然人群感染HBV核心基因啟動子(BCP)T1762/A1764雙突變、前核(PreC)A1896突變的分布狀況并初步分析其與基因型、HBeAg狀態(tài)、臨床類型之間的關(guān)系。 方法:選取2006年經(jīng)青海同德藏族人群乙肝患病率調(diào)查發(fā)現(xiàn)的表面抗原(HbsAg)陽性的311份血清,通過提取核酸和巢式PCR擴(kuò)增,獲得HBV S和C基因片段并直接測序。使用DNASTAR軟件,將樣本HBV S基因和C基因測序結(jié)果與GeneBank中的HBV參考株比對并進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生樹分析,確定其基因型;依據(jù)樣本S基因序列推導(dǎo)出其氨基酸序列,根據(jù)HBV包膜蛋白S上的共同抗原決定簇α與第122、127,160位氨基酸確定其血清亞型;以參考序列AB033556為標(biāo)準(zhǔn),將樣本C基因測序結(jié)果與之相比,確定是否發(fā)生BCP T1762/A1764雙突變、PreC A1896突變。最后,使用SAS 8.0軟件對結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析,率的比較采用χ錯誤!未指定書簽。2檢驗(yàn)及Fisher確切概率法。 結(jié)果: 1、311例來源于自然人群的HBsAg陽性血清中,S基因擴(kuò)增陽性304例,擴(kuò)增陽性率為97.8%;擴(kuò)增產(chǎn)物測序成功298例,測序成功率為98.0%。C基因擴(kuò)增陽性296例,擴(kuò)增陽性率為95.2%; C基因擴(kuò)增產(chǎn)物測序成功283例,測序成功率95.6%。S、C基因均擴(kuò)增陽性并測序成功的271例,占311例HBsAg陽性血清的87.1%。 2、271例基因型可確定樣本中,C/D重組型261例,占96.3 %,C型基因10例,占3.7 %;血清ayw2亞型259例,占95.6%,adr亞型10例,占3.7%,adw2亞型2例,占0.7%。C/D重組基因型中,男性128例,女性133例;C基因型中,男性4例,女性6例,不同基因型的性別構(gòu)成沒有差異(P=0.5745)。15歲組、15~組、30~組、50~組中C/D重組基因型分別有54、95、90、22例,C基因型分別有4、4、1、1例,不同基因型年齡別構(gòu)成亦無顯著差異(錯誤!未指定書簽。P=0.3261)。 3、271例基因型可確定樣本中,免疫耐受期慢性乙肝126例,其中C/D重組基因型119例,C基因型7例; HBeAg陽性的慢性乙肝32例,其中C/D重組基因型32例,C基因型0例;非活動性慢性乙肝90例,其中C/D重組基因型88例,C基因型2例;HBeAg陰性的慢性乙肝23例,其中C/D重組基因型22例,C基因型1例;不同基因型的臨床類型構(gòu)成沒有差異(P=0.3862)。 4、271例基因型可確定樣本中,發(fā)生BCP T1762/A1764雙突變的有56例,突變率為20.7%;其中,男性、女性分別為25、31,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.4944);各年齡組人數(shù)分別為8、14、23、11,突變率隨年齡增加而增高(P0.005);C基因型與C/D重組型中分別為0、56,C/D重組型突變率高于C基因型( P=0.0294);HBeAg陽性者與HBeAg陰性者中分別為20、36,HBeAg陰性者突變率高于HBeAg陽性者(P0.0001);免疫耐受期慢性乙肝、非活動性慢性乙肝、HBeAg陽性慢性乙肝、HBeAg陰性慢性乙肝者中分別為12、29、8、7,差別有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.0003),HBeAg陽性的慢性乙肝者BCP T1762/A1764雙突變發(fā)生率高于免疫耐受期的慢性乙肝者(P0.0001)。 5、271例基因型可確定樣本中,發(fā)生PreC A1896突變的有27例,占10.0%;男性、女性中分別為10、17,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.201);各年齡組分別為5、10、8、4,差異沒有統(tǒng)計意義(P0.25);C基因型與C/D重組型中分別為0、27,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.6053);HBeAg陽性者與HBeAg陰性者中分別為5、22,HBeAg陰性者突變率高于HBeAg陽性者(P0.0001);免疫耐受期慢性乙肝、非活動性慢性乙肝、HBeAg陽性慢性乙肝、HBeAg陰性慢性乙肝中分別為4、21、0、2,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.0001),其中非活動性慢性乙肝突變發(fā)生率高于免疫耐受期慢性乙肝(P0.0001)。 結(jié)論:青海省同德縣藏族人群感染HBV基因型以C/D重組型為主,血清型以ayw2為主;青海同德藏族人群感染HBV BCP T1762/A1764雙突變與PreC A1896突變流行程度相對較低;這兩種突變與HBeAg陰性有關(guān),BCP T1762/A1764雙突變可作為預(yù)測該地區(qū)慢性乙肝病人結(jié)局的分子生物學(xué)標(biāo)志。
【學(xué)位單位】:河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2009
【中圖分類】:R512.62;R450
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
研究論文 青海同德藏族人群感染乙肝病毒基因型及變異的初步研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    附圖
    附表
    討論
    結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
綜述 乙肝病毒感染自然史的研究進(jìn)展
致謝
個人簡歷

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本文編號:2876038

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