發(fā)布時(shí)間：2024-06-06 00:30

　　目的采用計(jì)算機(jī)分子對(duì)接技術(shù),研究芴酮衍生物與端粒G-四鏈體DNA的相互作用,為建立合理的化合物虛擬篩選模型提供依據(jù)。方法使用SYBYL-X 2.0的分子對(duì)接模塊,以2種結(jié)合了平面剛性骨架小分子的G-四鏈體DNA晶體結(jié)構(gòu)為目標(biāo)受體,在對(duì)接模型可靠性驗(yàn)證的基礎(chǔ)上,選取經(jīng)結(jié)構(gòu)優(yōu)化改造后的芴酮衍生物小分子為配體,以總評(píng)分為評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行分子對(duì)接,研究小分子配體與G-四鏈體DNA的相互作用方式。結(jié)果通過(guò)對(duì)比實(shí)驗(yàn)活性數(shù)據(jù),分子對(duì)接模型的總評(píng)分能較好地反映化合物的細(xì)胞毒性強(qiáng)弱,并給出了多種分子間的相互作用模式。結(jié)論通過(guò)分子模擬研究建立了比較可靠的對(duì)接模型,可在后續(xù)工作中指導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì),尋找高活性抗腫瘤化合物。

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

將原始配體從晶體結(jié)構(gòu)中抽取并重新對(duì)接回原位點(diǎn)后可看出其與原配體基本位于同一位置，其中2MS6配體總評(píng)分為5.53，相似度評(píng)分為0.64,3ES0配體對(duì)接總評(píng)分為9.552，相似度評(píng)分為0.725�；�于評(píng)分結(jié)果我們認(rèn)為對(duì)接模型能比較好地預(yù)測(cè)結(jié)合情況，可用于下一步的分子對(duì)接研究。重新....

6j為側(cè)鏈帶有2個(gè)正丁胺基乙基官能團(tuán)的化合物，其IC50值<10μmol/L，對(duì)接總評(píng)分均>8分。對(duì)接結(jié)果顯示（圖5),6j與2MS6的DT9、DT15、DT16形成π-π堆積效應(yīng)，與DT8、DT9、DT15、DT22形成碳-氫鍵，與DT15、DT23形成常規(guī)氫鍵；6j和3ES0....

圖3化合物4b與2種四鏈體晶體結(jié)構(gòu)的對(duì)接結(jié)果圖5化合物6j與2種四鏈體晶體結(jié)構(gòu)的對(duì)接結(jié)果

圖4化合物4d與2種四鏈體晶體結(jié)構(gòu)的對(duì)接結(jié)果3討論

本文編號(hào)：3990033