發(fā)布時間：2025-04-23 01:38

　　 目的通過分子動力學模擬研究化合物Cpd-22選擇性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的選擇性機制。方法采用分子動力學模擬技術(shù),通過均方根偏差計算,評價化合物Cpd-22對BACE-1和BACE-2蛋白波動的影響;通過主成分分析,評價BACE-1和BACE-2蛋白結(jié)合Cpd-22的構(gòu)象分布;通過溶劑可及表面積分析,評價BACE-1和BACE-2蛋白結(jié)合Cpd-22的蛋白在溶質(zhì)中的穩(wěn)定性;最后,通過結(jié)合自由能的計算與關(guān)鍵氨基酸殘基,凸顯BACE-1和BACE-2蛋白結(jié)合Cpd-22選擇性差異的關(guān)鍵氨基酸殘基。結(jié)果均方根偏差結(jié)果顯示化合物Cpd-22在BACE-1中的波動明顯小于在BACE-2中,說明Cpd-22在BACE-1中更為穩(wěn)定。主成分分析研究顯示,Cpd-22在BACE-1的構(gòu)象相比BACE-2中的分布更為集中,驗證了Cpd-22在BACE-1的構(gòu)象變化小的結(jié)論。溶劑可及表面積分析同樣顯示,在溶質(zhì)中,Cpd-22在BACE-1中的構(gòu)象相比在BACE-2中更為穩(wěn)定。關(guān)鍵氨基酸殘基分解顯示,氫鍵相互作用的關(guān)鍵氨基酸殘基包括Gln97、Gly98等...

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 BACE-1和BACE-2與Cpd-22復合物結(jié)構(gòu)準備
    1.2 BACE-1 和 BACE-2 與 Cpd-22 復合物模擬體系準備
    1.3 BACE-1 和 BACE-2 與 Cpd-22 復合物體系的模擬
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 Cpd-22 與 BACE-1 結(jié)合相比 Cpd-22 與 BACE-2 的均方根偏差更小
    2.2 Cpd-22與BACE-1結(jié)合相比Cpd-22與BACE-2結(jié)合的構(gòu)象分布更為集中
    2.3 Cpd-22與BACE-1結(jié)合相比Cpd-22與BACE-2結(jié)合的溶劑可及表面積更為穩(wěn)定
    2.4 Cpd-22 與 BACE-1 和 BACE-2 的結(jié)合自由能存在差異
3 結(jié)論



本文編號：4041012