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基于基因組重測(cè)序和基因編輯技術(shù)的甌江彩鯉黑斑體色遺傳機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2024-06-30 02:43
  體色是動(dòng)物最為明顯的表型性狀,具有多種生物學(xué)功能,同時(shí)也是自然選擇和人工選擇的目標(biāo)之一。脊椎動(dòng)物擁有最多的色素類型及圖案,其中又以硬骨魚(yú)類的色素模式最為豐富。由于脊椎動(dòng)物的色素細(xì)胞均起源于神經(jīng)嵴,而神經(jīng)嵴又涉及到許多種類細(xì)胞的發(fā)育,因此研究魚(yú)類體色的形成機(jī)制以及進(jìn)化過(guò)程,可以為脊椎動(dòng)物的進(jìn)化提供深入見(jiàn)解。魚(yú)類體色的形成涉及到色素的合成和轉(zhuǎn)移、色素細(xì)胞的分化和遷移等過(guò)程,這些生物學(xué)活動(dòng)中涉及到許多調(diào)控通路和基因的作用,同時(shí)也受到環(huán)境的影響。硬骨魚(yú)類中,鯉科魚(yú)類是體色類型最為豐富的種群之一。經(jīng)過(guò)多年選育,本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)建立了4種體色甌江彩鯉的純系,包括“大花”(紅色底色黑色斑塊,RB)、“粉花”(白色底色黑色斑塊,WB)、“全紅”(紅色,WR)和“粉玉”(白色,WW),并且4種體色可以穩(wěn)定遺傳給下一代,這為甌江彩鯉的體色遺傳研究奠定了基礎(chǔ)。為初步探明各體色鯉的進(jìn)化關(guān)系,篩選與鯉體色相關(guān)的候選基因,以及體色相關(guān)基因的調(diào)控作用,本論文以上述4種體色甌江彩鯉、興國(guó)紅鯉、荷包紅鯉及野鯉為實(shí)驗(yàn)材料,利用基因組重測(cè)序技術(shù)挖掘鯉的體色相關(guān)基因,并通過(guò)基因編輯技術(shù),驗(yàn)證這些基因的功能,相關(guān)研究成果如下:1....

【文章頁(yè)數(shù)】:99 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖1-16種色素細(xì)胞注:A為黑色素細(xì)胞,B為黃色素細(xì)胞,C為藍(lán)色素細(xì)胞,D為虹彩色素細(xì)胞,E為紅色素細(xì)胞,F(xiàn)為白色素細(xì)胞

圖1-16種色素細(xì)胞注:A為黑色素細(xì)胞,B為黃色素細(xì)胞,C為藍(lán)色素細(xì)胞,D為虹彩色素細(xì)胞,E為紅色素細(xì)胞,F(xiàn)為白色素細(xì)胞

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文2性條紋形成的關(guān)鍵,許多細(xì)胞表面分子與信號(hào)系統(tǒng)是這些交互作用的介質(zhì)[25-29]。這些研究都為魚(yú)類體色研究提供了重要的生物學(xué)信息。圖1-16種色素細(xì)胞注:A為黑色素細(xì)胞,B為黃色素細(xì)胞,C為藍(lán)色素細(xì)胞,D為虹彩色素細(xì)胞,E為紅色素細(xì)胞,F(xiàn)為白色素細(xì)胞Fig....


圖1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

圖1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文3在各類色素的合成機(jī)制中,當(dāng)屬黑色素合成通路的研究最為廣泛和深入。黑色素通路的末端最終合成真黑素和褐黑素,兩種色素之間的比例受到Agouti[35]、MC1R[36]等多種基因的調(diào)控。真黑素所占比例越高,呈現(xiàn)的顏色越偏向黑色,褐黑素所占比例越高,顏色越偏向....


圖2-1文庫(kù)構(gòu)建與測(cè)序流程

圖2-1文庫(kù)構(gòu)建與測(cè)序流程

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文13Samtools軟件將比對(duì)結(jié)果按照染色體位置進(jìn)行進(jìn)一步的排序,利用Picard軟件對(duì)由于PCR過(guò)程中產(chǎn)生的重復(fù)reads進(jìn)行標(biāo)記,避免影響后續(xù)的變異檢測(cè)。圖2-1文庫(kù)構(gòu)建與測(cè)序流程Figure2-1Thebasicprcessoflibrarycons....


圖2-27種鯉的主成分分析

圖2-27種鯉的主成分分析

上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文17Disruptiveinframeinsertion8370.0000Stopretainedvariant3750.0000Downstreamgenevariant3,708,6340.1281Synonymousvariant398,9130.0....



本文編號(hào):3998268

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