發(fā)布時間：2021-07-21 23:49

　　酸性轉(zhuǎn)化酶（acidinvertase,AIN）在菠蘿采后蔗糖降解過程中起著重要作用,基于菠蘿全基因組數(shù)據(jù)庫,預(yù)測菠蘿AIN家族基因并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,解析其在采后菠蘿不同貯藏溫度下的表達(dá)變化情況,為闡明AIN基因在采后菠蘿果實貯藏特性中的作用奠定基礎(chǔ)。以水稻AIN家族基因為探針,在菠蘿全基因組中鑒定到2個菠蘿細(xì)胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶基因（cell wall acid invertase, CWIN）和2個液泡酸性轉(zhuǎn)化酶基因（vacuolar acid invertase, VIN）,分別命名為AcCWIN1、AcCWIN2、AcVIN1、AcVIN2,設(shè)計編碼區(qū)引物進(jìn)行測序驗證,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。進(jìn)化分析結(jié)果表明,AcCWIN1、AcCWIN2和AcVIN1、AcVIN2蛋白分別歸于細(xì)胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶和液泡酸性轉(zhuǎn)化酶2個進(jìn)化支上,且均屬于糖基水解酶家族GH32,基因結(jié)構(gòu)、保守域和保守基序均一致。熒光定量分析結(jié)果表明,菠蘿果肉中AcVIN1和AcVIN2在果實采后貯藏過程中表達(dá)量升高,且AcVIN1在發(fā)生黑心病的部位大量表達(dá),而AcCWIN1和AcCWIN2在采后貯藏過程中表達(dá)量逐漸降低,... 

【文章來源】：熱帶作物學(xué)報. 2020,41(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

菠蘿Ac AINs基因家族的PCR擴(kuò)增

基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明，菠蘿的Ac AINs基因結(jié)構(gòu)均由外顯子和內(nèi)含子組成，Ac CWIN1和Ac VIN1均有5個內(nèi)含子，Ac CWIN2含有3個內(nèi)含子，而Ac VIN2含有6個內(nèi)含子（圖2）。與模式植物水稻、番茄及其他植物AINs蛋白序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明，Ac CWIN1、Ac CWIN2和Ac VIN1、Ac VIN2分別與其他植物的細(xì)胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶蛋白和液泡酸性轉(zhuǎn)化酶蛋白聚類在一起（圖3）。NCBI在線CDD分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，Ac CWIN1和Ac CWIN2均只含有1個Glyco＿32結(jié)構(gòu)域，而Ac VIN1和Ac VIN2除含有Glyco＿32結(jié)構(gòu)域外，在其N端還含有1個功能未知的DUF3357結(jié)構(gòu)域，說明該家族基因?qū)儆谔腔�水解酶基因家族GH32（圖4）。菠蘿Ac AINs蛋白保守基序MEME預(yù)測結(jié)果如圖5所示，基序分析中，4個Ac AINs蛋白的5個保守基序位置和序列均較為相似，并利用SMART和Pfam對預(yù)測的保守基序進(jìn)行命名（表4）。圖3 菠蘿與其他物種酸性轉(zhuǎn)化酶蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

菠蘿與其他物種酸性轉(zhuǎn)化酶蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹分析


本文編號：3296010