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乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析

發(fā)布時間:2025-03-18 04:53
   乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,與病毒進入細胞有關,它存在逆轉錄過程并且具有極強的潛伏性。本論文應用生物信息學分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在線分析軟件預測乙肝病毒S蛋白的理化性質和親疏水性、跨膜區(qū)域、信號肽特征、磷酸化位點、二級結構以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。結果顯示了乙肝病毒S蛋白由226個氨基酸組成,理論等電點是8.21,為不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為0.649,是疏水蛋白質,并且該蛋白存在信號肽,有4個跨膜區(qū),有30個潛在的磷酸化位點,主要二級結構為α螺旋和無規(guī)則卷曲,同時,結合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、線性表位、β轉角、柔性、抗原性的預測結果,可以找到潛在的抗原表位區(qū)域,為乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的參考依據,有利于進一步對乙型肝炎S蛋白的抗原性進行研究。

【文章頁數】:9 頁

【部分圖文】:

圖1S蛋白中各個氨基酸含量Fig.1ContentofeachaminoacidinSprotein

圖1S蛋白中各個氨基酸含量Fig.1ContentofeachaminoacidinSprotein

)、脯氨酸(Pro)、蘇氨酸(Thr)含量較高,分別占氨基酸總數的35%、25%、22%、19%。脂肪系數是99.60。理論等電點是8.21,原子總數是3569。帶負電荷殘基的Asp(天冬氨酸)和Glu(谷氨酸)的數目是27,帶正電荷殘基的Arg(精氨酸)和Lys(賴氨酸)的總數....


圖2S蛋白疏水性預測結果Fig.2HydrophobicitypredictionresultsforSprotein

圖2S蛋白疏水性預測結果Fig.2HydrophobicitypredictionresultsforSprotein

2.2乙肝病毒S蛋白的親水性(疏水性)乙肝病毒S蛋白的總平均親水性為0.649,可能是疏水蛋白質。該蛋白質的組成成分氨基酸的側鏈大部分或者全部由碳原子和氫原子組成,不太可能與水分子形成氫鍵。圖2疏水性的測試結果集中反映了不同氨基酸位置的親疏水性分布情況,閾值線為0,閾值線以上部分....


圖3S蛋白二級結構Fig.3SecondarystructureofSprotein

圖3S蛋白二級結構Fig.3SecondarystructureofSprotein


圖4S蛋白信號肽預測結果Fig.4SignalpeptidepredictionresultsforSprotein

圖4S蛋白信號肽預測結果Fig.4SignalpeptidepredictionresultsforSprotein

2.4乙肝病毒S蛋白的信號肽、跨膜區(qū)及磷酸化位點分析信號肽的本質是一段氨基酸序列,一般位于多肽鏈的末端,在蛋白質跨膜轉運過程中起作用。如圖4所示,S經常被用于預測信號肽的剪切位點[8],該預測結果中S分值最大為0.606,大于信號肽閾值0.5,S分值與閾值線的交點處的氨基酸位點為....



本文編號:4036033

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