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Asn-145位點(diǎn)在HIV膜融合抑制劑設(shè)計(jì)中的作用與機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2025-01-15 11:48
  HIV膜融合抑制劑是一種多肽類藥物,它通過特異靶向HIV gp41NHR區(qū)域,抑制融合過程中核心六螺旋束的形成,從而阻斷病毒入侵,在感染的初始階段切斷HIV病毒的傳播。2003年,美國FDA批準(zhǔn)了臨床使用的唯一基于HIV表面融合蛋白gp41靶點(diǎn)的抑制劑恩夫韋肽,即T20。該多肽對逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑和蛋白酶抑制劑耐藥及不耐藥病人均具有很好的治療效果,且副作用低,然而T20多肽存在著半衰期短,容易耐藥等問題。理想的膜融合抑制劑應(yīng)具有水溶性好,活性高,穩(wěn)定,價(jià)格低廉等特點(diǎn),因此亟需設(shè)計(jì)出一種具有高抗病毒活性,高廣譜活性、高抗耐藥性和較短片段的膜融合抑制多肽藥物。Naito等設(shè)計(jì)的SC29EK是一個含有E-K模體(X-EE-XX-KK)的29個氨基酸多肽,其活性和抗耐藥性較T20均明顯提升,為了進(jìn)一步探究SC29EK作用機(jī)制,我們將SC29EK進(jìn)行逐個截短,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SC29EK與SC28EK之間,僅相差一個氨基酸Asn但是抗病毒活性存在顯著差異,這是否提示SC29EK的最后一個氨基酸Asn(位于病毒的gp41-145位點(diǎn))對多肽與病毒結(jié)合有重要作用,據(jù)此我們開展了一系列實(shí)驗(yàn)。本次研究主要是針對gp4...

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖5:?ELISA六聚體競爭實(shí)驗(yàn)??A:包被識別抗體17C8,N36為N肽,檢測SC29EK與SC28EK之間差異

圖5:?ELISA六聚體競爭實(shí)驗(yàn)??A:包被識別抗體17C8,N36為N肽,檢測SC29EK與SC28EK之間差異

的C肽能通過與N肽結(jié)合而抑制C34-Biot的結(jié)合,最終檢測C34-Biot/N肽的復(fù)??合物的含量從而反映出C肽的結(jié)合能力。本次實(shí)驗(yàn)中選用了六聚體識別抗體??NC-1/17C8,二者識別位點(diǎn)略微差異。結(jié)果顯示如下,圖5A中,所用的抗體是??17-C8,在與N36競爭結(jié)合的過程中....


圖6:?SC29EK/N36復(fù)合物在特定條件下形成的晶體??

圖6:?SC29EK/N36復(fù)合物在特定條件下形成的晶體??

院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院?碩團(tuán)供氫給1124上的0原子,形成一個2.6?A距離的氫鍵。K1132的0原子,形成3.3?A距離的鹽橋。S138的0H供氫給L成一個2.6?A距離的氫鍵。C肽鏈內(nèi)鹽橋結(jié)構(gòu)。K122的NH基基團(tuán),二者距離3.9A。??


圖7:?SC29EK/N36鏈內(nèi)作用的示意圖??A:圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰白色a螺??旋鏈,虛線表示作用力包括鹽橋和氫鍵

圖7:?SC29EK/N36鏈內(nèi)作用的示意圖??A:圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰白色a螺??旋鏈,虛線表示作用力包括鹽橋和氫鍵

圖7:?SC29EK/N36鏈內(nèi)作用的示意圖??圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰,虛線表示作用力包括鹽橋和氫鍵。??示鏈內(nèi)作用力,黑色直線為鹽橋作用力,綠色直線為氫鍵。??第二,鏈間作用,我們發(fā)現(xiàn)SC29EK會與相....


圖8:?SC29EK/N36鏈間作用力的示意圖??A:圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰白色ct螺??旋鏈,虛線表示作用力,包括鹽橋和氫鍵

圖8:?SC29EK/N36鏈間作用力的示意圖??A:圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰白色ct螺??旋鏈,虛線表示作用力,包括鹽橋和氫鍵

圖8:?SC29EK/N36鏈間作用力的示意圖??A:圖形顯示是由Pymol軟件展示,氨基酸用stick模式顯示,SC29EK為綠色a螺旋鏈,N36為灰白色ct螺??旋鏈,虛線表示作用力,包括鹽橋和氫鍵。展示六螺旋束中間區(qū)域的作用力情況。??B:展示展示六螺旋束末端區(qū)域作用力。?....



本文編號:4027351

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