發(fā)布時間：2024-09-17 15:12

　　有性生殖的維持和進化一直受到生物學家的關注,目前關于異質環(huán)境促進有性生殖進化的少量證據(jù)都是在實驗室人工模擬的結果,因時間跨度不夠長和環(huán)境成分簡單而受到質疑。滇池是云南有名的淡水湖泊,該湖泊不僅受到嚴重的氮磷污染,同時重金屬含量也高于云南省土壤背景值,是天然的異質環(huán)境。彎孢節(jié)叢孢Arthrobotrys musiformis屬于子囊菌門Ascomycota圓盤菌科Orbiliaceae,圓盤菌屬Orbilia的無性態(tài),廣泛分布于各種生境中,既能進行有性生殖,也能進行無性繁殖,是研究生境對真菌有性生殖影響的良好材料。本研究選取從滇池底泥(簡稱為DC)、滇池旁的西山農(nóng)田土壤(XS)、圓盤菌屬子囊孢子(S)分離的三個A.musiformis 群體為研究材料,從線粒體基因組多樣性的角度揭示異質環(huán)境對A.musiformi 的遺傳分化及有性生殖的影響。主要研究結果如下:1.A.musiforis 的系統(tǒng)發(fā)育分析聯(lián)合ITS,RPB2和TEF三個片段,對48個A.musiformis 菌株進行系統(tǒng)學分析的結果顯示,所有該種菌株都聚成一支,和同屬的外群少孢節(jié)叢孢A.oligospora差異明顯,證明所選菌...

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 線粒體在群體遺傳中學中的應用
        1.1.1 真菌線粒體基因組的研究概況
        1.1.2 線粒體DNA作為生物多樣性標記原因
        1.1.3 真菌線粒體基因組的遺傳多態(tài)性和進化速率
            1.1.3.1 基于RFLP標記的研究
            1.1.3.2 基于多位點序列的研究
            1.1.3.3 基于完整的線粒體基因組序列分析的研究
    1.2 捕食線蟲真菌群體遺傳學研究進展
    1.3 異質環(huán)境對真菌基因組多樣性的影響
    1.4 真菌的交配型基因
    1.5 真菌有性生殖和異質環(huán)境的聯(lián)系
    1.6 本研究的主要目標
第二章 實驗材料與方法
    2.1 實驗菌株
    2.2 實驗材料
        2.2.1 實驗試劑
        2.2.2 實驗器材
        2.2.3 培養(yǎng)基
    2.3 試驗方法
        2.3.1 實驗菌株DNA的提取
        2.3.2 目的片段的擴增
            2.3.2.1 擴增引物
            2.3.2.2 擴增體系
            2.3.2.3 擴增程序
        2.3.3 數(shù)據(jù)分析
            2.3.3.1 PCR產(chǎn)物的檢測及測序
            2.3.3.2 序列的拼接、比對
            2.3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.3.4 MAT基因的獲取
            2.3.4.1 數(shù)據(jù)獲取
            2.3.4.2 數(shù)據(jù)組裝及分析
        2.3.5 線粒體基因組的獲取
            2.3.5.1 線粒體基因組的測序
            2.3.5.2 線粒體基因組序列拼接
            2.3.5.3 線粒體基因組注釋
            2.3.5.4 線粒體基因組的提交
            2.3.5.5 線粒體基因組的分析
            2.3.5.6 基于線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
第三章 結果與分析
    3.1 多基因聯(lián)合確定種
        3.1.1 三個基因的獲得片段統(tǒng)計
        3.1.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.1.3 討論
    3.2 交配型基因分析
        3.2.1 討論
    3.3 彎孢節(jié)叢孢(A. musiformis)線粒體基因組結構
        3.3.1 A.musiformis YMF 1.01900 S
        3.3.2 A.musiformis YMF 1.03721 DC
        3.3.3 A.musiformis YMF 1.03753 XS
    3.4 三株A.musiformis線粒體基因組對比分析及討論
        3.4.1 基于線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.4.2 三株彎孢節(jié)叢孢線粒體基因組總覽
            3.4.2.1 NADH1多位點核苷酸突變驗證
            3.4.2.2 NADH5及NADH6內(nèi)含子存在/缺失驗證
        3.4.3 相對同義密碼子使用對比(RSCU)
        3.4.4 線粒體基因組比對的可視化分析
        3.4.5 討論
第四章 全文總結
參考文獻
碩士學位期間完成的科研成果
致謝



本文編號：4005636