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成人退變性脊柱側(cè)凸相關(guān)circRNA的篩選及其生物學(xué)功能的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2025-03-31 23:22
  [目的]通過高通量測(cè)序技術(shù)分析成人退變性脊柱側(cè)凸(Adult degenerative scoliosis,ADS)患者外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA基因表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)的circRNA,對(duì)差異性表達(dá)的circRNA進(jìn)行生物學(xué)信息分析。構(gòu)建circRNA-miRNA相互調(diào)控作用網(wǎng)絡(luò)圖,尋找差異性表達(dá)的circRNA與miRNA結(jié)合位點(diǎn),探討差異性表達(dá)的circRNA在ADS患者中的生物學(xué)功能,并發(fā)現(xiàn)靈敏度及特異度高的潛在診斷標(biāo)志物,為深入認(rèn)識(shí)ADS在轉(zhuǎn)錄組學(xué)層面的發(fā)生發(fā)展機(jī)制及診治提供理論基礎(chǔ)。[方法]收集ADS患者、腰椎間盤突出癥患者(Lumbar disc herniation,LDH)、健康對(duì)照者外周血5ml,每組各3例。提取樣本總RNA,利用NanoDropND-1000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)總RNA的濃度及純度,變性瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA的完整性。根據(jù)總RNA質(zhì)檢結(jié)果,符合高通量測(cè)序技術(shù)要求后,利用第二代高通量Illumina HiSeq測(cè)序技術(shù)平臺(tái)檢測(cè)外周血中轉(zhuǎn)錄組circRNA的表達(dá)譜,篩選出差異性表達(dá)的circRNA。對(duì)差異表達(dá)的circRNA進(jìn)行火山圖分析、聚類分...

【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1所有樣本總RNA瓊脂糖凝膠電泳??

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■BiBiB??■HHi??注:Marker?yàn)椋裕颍幔睿?2K?Plus,圖中對(duì)應(yīng)上樣序列為1-9原液上樣lul??圖1所有樣本總RNA瓊脂糖凝膠電泳??2ADS、LDH外周全血中circRNA的表達(dá)譜分析??2.1統(tǒng)計(jì)原始序列數(shù)據(jù)??高通量測(cè)序得到的原始測(cè)序結(jié)果,其序列中可能含....


圖2ADS_1原始測(cè)序序列類型??27??

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圖4ADS—3原始測(cè)序序列類型??

圖4ADS—3原始測(cè)序序列類型??

Classification?of?Raw?Reads(ADS_2)??Clean?Reads?(44295924,?95.93%)??Containing?N?(73162,?0.16%)??Low?Quality?(349101,?0.76%)??Adapter?Relate....


圖6?LDH_2原始測(cè)序序列類型??

圖6?LDH_2原始測(cè)序序列類型??

Classification?of?Raw?Reads(LDH_l)??,1?_??Clean?Reads?(46592537,?95.89%)??Containing?N?(623101,?1.28%)??Low?Quality?(349383,?0.72%)??Adapter....



本文編號(hào):4038575

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